Einfluss von Claudin-4 auf die Transkription tumorassoziierter Gene in SUIT-007 Pankreaskarzinomzellen

Die Proteine der Claudin-Familie sind wesentlich am Aufbau von Tight Junctions beteiligt und gehören somit zur Gruppe der Adhäsionsmoleküle. Für viele Claudine konnte eine differentielle Expression und Funktion in verschiedenen Tumoren des Menschen nachgewiesen werden. Claudin-4, ein Vertreter der Claudin-Familie, wird in humanen Pankreaskarzinomzellen überexprimiert. Zudem fungiert Claudin-4 als potenter Inhibitor für Invasion und Metastasierung in Pankreaskarzinomzellen. Um den Einfluss von Claudin-4 auf die Expression anderer tumorassoziierter Gene zu untersuchen, wurde in dieser Arbeit das Expressionsprofil von Pankreaskarzinomzellen der Zelllinie SUIT-2 007, welche Claudin-4 indizierbar überexprimierten, mit demjenigen von nicht stimulierten Zellen verglichen. Hierzu wurde die cDNA-Array Technologie verwendet, und ca. 2000 Gene gleichzeitig auf ihre Expression untersucht. Es konnte gezeigt werden, dass sich die Expressionsprofile beider Gruppen nur gering unterscheiden. Gene mit detektierter differentieller Expression wurden nach Kriterien steigender Stringenz geordnet, so dass drei Gruppen unterschiedlichen Signifikanzniveaus gebildet werden konnten. Aus jeder Gruppe wurden Gene zur Überprüfung der Arrayergebnisse mittels Northerblotanalyse und RT-PCR ausgewählt. Von diesen konnte für das Gen SREBP-1 - aus der Gruppe der Gene mit höchstem Signifikanzniveau - das Ergebnis der Arrayexperimente bestätigt und somit ein Einfluss von Claudin-4 auf seine Expression nachgewiesen werden. Außerdem zeigt diese Arbeit, dass die strikte Anwendung stringenter Signifikanzkriterien bei der Auswertung und Interpretation von Array-Experimenten unbedingt gefordert werden muss. Insbesondere kam zum Ausdruck, dass im Bereich schwach exprimierter Gene die Grenzen der Mikroarray-Methode liegen, so dass eine Mindestexpressionsschwelle als Signifikanzkriterium unbedingt gefordert werden muss und diese nicht zu tief angesetzt werden sollte