Modélisation, analyse et simulationdes réseaux génétiques

A l’interface de la biologie, de l’informatique et des mathématiques, les méthodes de modélisation, d’analyse et de simulation permettent de décrire et de prédire le comportement de réseaux de régulation génétique complexes. Ces méthodes se déclinent en quatre principales catégories en fonction des notions mathématiques utilisées : le recours aux concepts de la théorie des graphes, l’utilisation d’équations différentielles, les formalisations booléennes ou logique généralisée, ou encore une description stochastique des transitions entre états moléculaires. Au vu des données génétiques et moléculaires actuellement disponibles, les approches qualitatives (éventuellement sur base de modèles quantitatifs) semblent particulièrement indiquées. Encore en cours de développement, de telles approches et leur automatisation devraient rapidement devenir incontournables pour caractériser les comportements dynamiques normaux ou pathologiques des réseaux biologiques, pour prédire les effets de perturbations, ou encore pour concevoir une nouvelle génération d’outils thérapeutiques ou agronomiques