Isolement et caractérisation de bactéries marines oligotrophes

Une part importante des océans est caractérisée par une pauvreté en nutriments et une faible concentration en chlorophylle. Dans ces environnements oligotrophes, les bactéries sont malgré tout abondantes et jouent un rôle fondamental dans la reminéralisation de la matière organique dissoute. Les bactéries adaptées à l'oligotrophie se distinguent de celles adaptées à des milieux plus riches en nutriments par certaines caractéristiques génétiques et métaboliques. De ce fait, les milieu de culture riches en matière organique couramment utilisés en bactériologie sont peu adaptés à la croissance et à l'isolement de nombreuses bactéries marines. De nouvelles techniques de culture ont été proposées pour les bactéries oligotrophes et ont permis d'isoler de nouvelles espèces ou de nouveaux genres bactériens. Pelagibacter ubique et Sphingopyxis alaskensis font partie de ces bactéries récemment isolées du milieu marin dont l'étude a permis de mieux comprendre les adaptations des bactéries marines aux conditions oligotrophes