Algorithms for molecular geometry problems

Orientador: Carlile Campos LavorDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação CientíficaResumo: Neste trabalho, analisamos dois algoritmos da literatura para o "Molecular Distance Geometry Problem" (MDGP) e propomos um novo algoritmo que mantém a qualidade das soluções obtidas pelos dois anteriores e apresenta ganhos em termos de eficiência computacional. O MDGP consiste em determinar as posições dos átomos de uma molécula, no espaço tridimensional, a partir de um conjunto de distâncias entre eles. Quando todas as distâncias são conhecidas, o problema pode ser resolvido em tempo polinomial. Caso contrário, é um problema NP-difícilAbstract: In this work, we analyse two algorithms from the bibliography to solve the so-called "Molecular Distance Geometry Problem" (MDGP). Then, we propose a new algorithm that keeps the quality on the solutions obtained by both the previous ones and shows gains regarding computacional efficiency. The MDGP consists on the determination of positions of atoms in a molecule, on the tridimensional space, from a set containing distances among them. When all the distances are known, the problem might be solved in polynomial time. Otherwise, it is an NP-hard problemMestradoMatemática da ComputaçãoMestre em Matemática Aplicad