Genetic Variability of the Control Region in the mtDNA (D-Loop) in Brazilian Caipira s chicken

The domestic chicken (Gallus gallus domesticus) was originated by the jungle red flow chicken (Gallus gallus) and the bankiva chicken (Gallus gallus bankiva). Since the domestication, around 7000 years ago in the Asian Southeast, the chicken came with the human migration, and then scattered to the entire world and arrived to Brazil around 1500 BC. In Brazil has came breeds from Europe and Asia, and they were let in freedom and they crossed at random breeding generating the chicken as know as Brazilian caipira chicken. With development of the national chicken producing the caipira s chickens were forgotten in countryside in third world countries, to be considered less productive. However, with the growing consumption of product considered healthier, this chicken was recovered. In additional, to be more rustic and disease resistance, because their high genetic variability, these chickens are considered an important source for alleles which can be use in the animal genetic improvement. The mitochondrial DNA (mtDNA) is characterized by had an exclusively maternal inheritance and the most used method amplify the mtDNA control region (D-loop), which has a high genetic variability. This study aimed to investigate the origin and composition of the maternal lines on these lineages. . We collected blood samples from 105 Brazilian blue-egg caipira s chickens. The fragments were amplified by PCR, sequenced, and analyzed by the MEGA 4.0 software. As result, 89,52% of the chicken belong to the clade A, 7,62% to C e 2,86% to E, which means that participated animals most from Asian and few from European origin, in the maternal lineages. The results indicate that these strains analyzed of Brazilian chickens, have a higher genetic variability so that observed in non-commercial poultry and conserve a strong founder effectA galinha doméstica (Gallus gallus domesticus) é originária da galinha vermelha do mato (Gallus gallus) e galinha bankiva (Gallus gallus bankiva). Desde a sua domesticação, que ocorreu por volta de 7000 anos atrás no Sudeste asiático, a galinha acompanhou a migração humana, e assim se espalhou pelo mundo inteiro, chegando ao Brasil por volta do ano de 1500. No Brasil chegaram aves oriundas da Europa e da Ásia, e aqui foram deixadas em liberdade e cruzaram de forma aleatória gerando o que hoje se conhece como galinha caipira. Com o desenvolvimento da avicultura, estas aves foram esquecidas nos quintais de casa, por serem consideradas menos produtivas. No entanto, com o crescente aumento no consumo de produtos considerados naturais, esta ave voltou ao mercado. Por ser mais rústica e resistente a doenças, em virtude de sua variabilidade genética alta, estas aves também são consideradas uma importante fonte de alelos que podem ser utilizados no melhoramento animal. O DNA mitocondrial (mtDNA) caracteriza-se por ser de exclusiva herança materna, sendo o método mais utilizado consiste em amplificar a região controle (alça-D), que possui grande variabilidade genética. Desta forma, este trabalho tem como objetivo determinar a origem e composição das linhas maternas nestas linhagens. Foram coletadas amostras de sangue de 105 galinhas caipiras de ovos azuis oriundas do município de Dois Lajeados-RS. Os fragmentos foram amplificados pela PCR, sequenciados, e analisados pelo software MEGA 4.0. Como resultado, 89,52% das aves pertencem ao haplogrupo A, 7,62% ao C e 2,86% ao E. Para a composição desta ave foram utilizados em sua maioria aves de origem asiática e um pouco de origem europeia, em sua linhagem materna. Os resultados obtidos indicam que estas aves analisadas, apresentam uma variabilidade genética semelhante a aves não comerciais e conservam ainda um efeito fundador muito fort