RT-PCR in semen samples belonging to positive horses to equine arteritis virus: analysis of new Argentinean sequences

Arteritis Viral Equina (AVE) ocasiona infecciones, en su mayoría subclínicas, pero puede causar abortos y enfermedad respiratoria. Los ORF5 y ORF6 del virus codifican las proteínas de envoltura GP5 y M cuya interacción es crítica para la infectividad y expresión de determinantes antigénicos del virus. Existe un solo serotipo de AVE, aunque hay variabilidad entre aislamientos de regiones geográficas diferentes, sobre todo a nivel del ORF 5. En Argentina se realizaron 5 aislamientos en 2001, 2002 y 2007. En este trabajo se caracterizan y comparan entre sí nuevas secuencias de virus de arteritis obtenidas de muestras de semen de archivo con las 5 cepas Argentinas. En el análisis de identidad, se evidencia que las secuencias LP02/R, LP02/C, LP02/P, LT-LP-ARG, RO-LP-ARG y RZ-LP-ARG resultaron las más similares entre sí (99%) mientras que las secuencias RO-LP-ARG y LT-LP-ARG tienen 100% de identidad. En el árbol filogenético, todas las secuencias a excepción de LP01 forman un único cluster. La secuenciación de esta porción del genoma permite determinar las características moleculares de las cepas circulantes en Argentina, aunque en estudios futuros debería determinarse si estas variaciones son responsables de las diferencias de tropismo, antigenicidad y virulencia de las cepas.Equine arteritis virus causes subclinical infections characterized by respiratory disease, abortion or pneumonia. The interaction of proteins GP5 and M, codified on ORF 5 and 6, respectively, is critical for infectivity. Only one serotype of EAV is described although variations between isolates from different geographic regions exist. In Argentina 5 EAV strains were isolated in 2001 (LP01 strain) in 2002 (LP02/R, LP02/C and LP02/P) and in 2007 (LT-LP-ARG strain). In this work we compare and characterize new sequences of EAV obtained from 3 archive semen samples together with the Argentinean strains. LP02/R, LP02/C, LP02/P, LT-LP-ARG, RO-LP-ARG and RZ-LP-ARG showed 99% homology by sequences identity, meanwhile RO-LP-ARG and LT-LP-ARG have 100% identity. Phylogenetic tree analysis identified one cluster including LP02/R, LP02/P, LP02/C, LT-LP-ARG, RO-LPARG, RZ-LP-ARG and KB-LP-ARG. The results obtained allowed us to determine molecular characteristics between the Argentinean strains. Further studies will be needed in order to determine if the variations found are responsible for antigenicity, tropism and virulence.Facultad de Ciencias Veterinaria