Estudio y caracterización del microbioma viral en pacientes pediátricos con infección aguda del tracto respiratorio

El avance de la tecnología de secuenciación de nueva generación supone una oportunidad para la mejora de la investigación y el diagnóstico, abriendo un horizonte de retos y avances para un laboratorio de referencia. La posibilidad de caracterizar con un único sistema la comunidad viral presente en una muestra biológica y detectar virus, conocidos o no, sin necesidad de cultivar, clonar o restringir la técnica a un virus concreto supone una gran ventaja.El empleo de este sistema en el estudio del tracto respiratorio es un hilo conector que nos lleva desde la puesta a punto de la técnica hasta la comprensión de la ecología de la infección respiratoria y basándose en esto hemos desarrollado nuestros objetivos. El estudio del viroma respiratorio de pacientes pediátricos nos permitió desarrollar los protocolos de enriquecimiento por tres métodos diferentes, de enriquecimiento mediante captura por sondas y la amplificación independiente de secuencia por oligonucleótido único. Estos métodos han sido posteriormente aplicados en el estudio de viroma respiratorio por una parte en niños y en personas adultas, y por otra en hospedadores diferentes al ser humano como son los murciélagos. Este sistema ha sido el método desarrollado y empleado fundamentalmente en este trabajo..