Aceleración de un Programa de Reconstrucción Iterativa para PET mediante el uso de GPUs

Actas de: XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010). Madrid, 24-26 de noviembre de 2010.En este trabajo se muestran los principales pasos seguidos para modificar el programa de reconstrucción de imagen tomográfica FIRST (Fast Iterative Reconstruction Software for (PET) Tomography) de forma que las partes de la reconstrucción que requieren un mayor tiempo de cálculo (proyección y retroproyección) puedan ser ejecutadas en las unidades de procesamiento gráfico (GPUs) de un ordenador. En la actualidad, las GPUs superan a las CPUs en capacidad de cómputo en paralelo,. El código original ha sido reescrito en C con extensiones de CUDA, buscando en todo momento hacer un uso óptimo de las propiedades de la GPU. De esta forma se ha logrado reducir el tiempo requerido para realizar cada reconstrucción en un factor mayor de 70. Esta mejora tan notable en el tiempo de reconstrucción abre la puerta a un uso más generalizado de este tipo de métodos iterativos.Este trabajo ha sido financiado en parte por el MEC (FPA2007-62216), la UCM (Grupos UCM, 910059), el CPAN (Consolider-Ingenio 2010, CSPD-2007-00042), la red RECAVA-RETIC, el proyecto ARTEMIS (S2009/DPI-1802, Fondo Europeo de Desarrollo Regional) y el proyecto ENTEPRASE (PSE-300000-2009-5, MICINN. España).Publicad