Studi Hubungan Kekerabatan Ikan Kerapu (Genus Epinephelus) dari Kepulauan Lesser Sunda Berdasarkan Gen DNA Mitokondria 16s rRNA

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan kekerabatan antar spesies dalam genus Epinephelus di kawasan Lesser Sunda berdasarkan analisis molekuler gen DNA mitokondria 16S rRNA. Tahapan metode penelitian adalah pengumpulan sampel Epinephelus di kepulauan Lesser Sunda; ekstraksi DNA dengan menggunakan kit TIAGEN; sekuensing DNA; rekonstruksi pohon filogenetik dengan program Cipress Online dan Mr.Bayes 3.0b4, menggunakan analisis Maximum Parsimony, Maximum Likelihoond dan Bayesian Inference; dan analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa genus Epinephelus terbagi menjadi beberapa kelompok monofiletik, yaitu kelompok Epinephelus yang berasal dari kepulauan Lesser Sunda (E. bleekeri, E. maculatus, E. macrospilos, E. ongus, E. quoyanus, E. faveatus, E. radiatus, dan E. corallicola) dan Epinephelus yang berasal dari China dan India (E. bleekeri, E. quoyanus, E. radiatus, E. maculatus). Kelompok Epinephelus yang berasal dari Lesser Sunda memiliki topologi yang valid karena didukung oleh nilai bootstrap yang tinggi yaitu sebesar 100/62/100 (MP/ML/BP). Nilai p-distance dari spesies di kepulauan Lesser Sunda juga sangat rendah yang menandakan bahwa spesies Epinephelus di daerah tersebut berkerabat sangat dekat. Rentang nilai p-distance genus Epinephelus di Kepulauan Lesser Sunda adalah sebesar 0,2 – 9 %. Hubungan kekerabatan dan evolusi genus Epinephelus di wilayah Indo-Pasifik hingga ke Indonesia dan wilayah lainnya dipengaruhi oleh pembentukan dan pemisahan pulau-pulau di Indo-Pasifik