Penggunaan Primer Specifik pada Daerah ITS (Internal Transcribed Spacer) untuk Mengamplifikasi DNA Ribosom Khamir Laut

Perairan laut Indonesia kaya akan potensi mikrobia laut. Saat ini mikrobia potensial di lautan kita yang belum banyak dimanfaatkan adalah khamir laut. Khamir laut potensial untuk dimanfaatkan diberbagai bidang, salah satunya industri makanan, fermentasi, riset biomedik, farmakologi, teknologi lingkungan dan pengembangan sains. Tetapi hingga kini di Indonesia belum ada bank data hasil penelitian khamir laut. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan data molekular tentang profil pita DNA ribosom isolat khamir laut yang teramplifikasi pada daerah ITS dan untuk mengetahui identitas isolat khamir laut berdasarkan profil pita DNA ribosom yang teramplifikasi pada daerah ITS. Penelitian telah dilaksanakan di Laboratorium mikrobiologi Fakultas Perikanan dan Laboratorium Rekayasa Genetika, Balai Pengkajian Bioteknologi –BPPT, Serpong, Tangerang pada bulan Juni sampai Oktober 2009. Tahapan penelitian ini meliputi : pemurniaan biakan khamir laut, pengamatan morfologi, isolasi DNA total dan amplifikasi DNA ribosom pada daerah ITS ( Internal Transcribed Spacer ). Hasil penelitian didapatkan satu isolat khamir laut yang memiliki ukuran panjang 9-28 µm dan lebar 1,5-3 µm memiliki hifa tidak bersekat, berwarna krem transparan, terdapat miselium sejati dan tidak ada pseudomycelium . Pertumbuhan vegetatifnya berupa pertunasan multilateral. Selanjutnya h asil amplifikasi DNA dengan teknik PCR menggunakan primer ITS1 dan ITS4 terhadap isolat khamir laut menghasilkan satu pita dengan ukuran berkisar antara 500-750 bp