Studi Divergensi Genetik Genus Limnonectes Fitzinger, 1843 di Paparan Sunda menggunakan 12S rRNA, tRNAval, dan 16S rRNA

Sejarah evolusi geologi Paparan Sunda membentuk pola persebaran genus Limnonectes yang banyak tersebar di wilayah tersebut. Penelitian mengenai sistematika, penguraian hubungan kekerabatan, dan penemuan spesies baru dari Limnonectes di Paparan Sunda telah banyak dilakukan untuk mengevaluasi diversitas Limnonecetes di Paparan Sunda. Namun, tahapan lanjutan dari studi filogenetik seperti studi estimasi waktu divergensi genetik belum pernah dilakukan. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui filogenetik Limnonectes, hubungan proses evolusi Paparan Sunda dengan waktu divergensi genetik Limnonectes, dan biogeografi Limnonectes di Paparan Sunda dan sekitarnya. Metode yang digunakan adalah analisis filogenetik dan estimasi waktu divergensi genetik menggunakan 24 sampel sekuen 12S rRNA, tRNAVal, dan 16S rRNA Limnonectes dan tiga Outgroup. Hasil penelitian menunjukkan hubungan kekerabatan Limnonectes di Paparan Sunda yaitu tergolong genus yang monofiletik, terbagi atas 4 clade besar, yaitu: clade Sumatera, Jawa, dan Nusa Tenggara; clade Dataran Asia (Thailand dan Vietnam); clade Borneo; dan clade Filipina dan Sulawesi. Waktu separasi spesies Limnonectes terjadi pada sekitar 55 - 6 Mya. Kemungkinan hubungan filogenetik spesies antar pulau di Paparan Sunda dipengaruhi oleh barrier fisik / spesiasi alopatrik akibat evolusi geologi di Paparan Sunda, karena hasil estimasi waktu pemisahan spesies antar pulau sama dengan hasil studi estimasi waktu pemisahan pulau – pulau di Paparan Sunda