Virtual Screening of Potential Drug-Like Inhibitors Against p53-mortalin Interaction

Sel kanker memiliki mekanisme molekuler yang berbeda dengan sel normal. Pada beberapa sel kanker diketahui terjadi overekspresi protein mortalin yang berikatan dengan protein p53 wild type. Interaksi ini menyebabkan p53 inaktif sehingga sel kanker terus berproliferasi dan immortal. Interaksi p53-mortalin sangat penting untuk keberlangsungan sel kanker karena ketika p53 tidak berikatan dengan mortalin maka protein p53 akan ditranslokasikan ke inti dan mampu menginduksi apoptosis sel. Berdasarkan hal tersebut maka penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi p53-mortalin secara molecular docking dan menyeleksi senyawa yang berpotensi sebagai inhibitor interaksi p53-mortalin secara virtual screening. Interaksi p53-mortalin secara molecular docking akan memberikan informasi tentang struktur kompleks interaksi model 3D suatu protein. Model 3D protein p53 didapatkan dari Protein Data Bank (1AIE) sedangkan model 3D protein mortalin merupakan hasil homology modeling. Hasil interaksi menunjukkan tetramerization domain dari protein p53 diketahui berikatan dengan substrate binding domain dari mortalin dengan energi bebas -31.89 kcal/mol dan distabilkan dengan dua tipe interaksi yaitu interaksi elektrostatik dan interaksi hidrofobik. Sisi pengikatan mortalin terhadap p53 akan menjadi target dari senyawa drug-like dan dianalisis melalui proses virtual screening (PyRx 0.8). Senyawa hasil virtual screening yang berpotensi sebagai inhibitor interaksi p53-mortalin yaitu ZINC01019934, ZINC00624418 dan ZINC0064532. Kemudian ketiga senyawa dianalisis secara molecular dynamics dan diketahui bahwa senyawa ZINC01019934 memiliki potensi yang paling bagus sebagai inhibitor karena selain memiliki stabilitas ikatan yang baik dengan mortalin juga mampu mengganggu interaksi p53-mortalin