Analisis Polimorfisme Gen Calpastatin (CAST) Sapi PO Ekson 19-20 dengan Metode PCR-RFLP

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui polimorfisme gen calpastatin (CAST ) sapi PO ekson 19-20. Sampel darah diambil dari 10 sapi PO. Uji kuantitatif DNA diukur dengan spektrofotometer pada panjang gelombang 260 nm dan 280 nm. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR menggunakan dua primer, F 5’-ATC CAG AAG ACG GAA AGC CT-3’, R 5’-CCA AAG AAG AGG ATC GTG AG-3’. Hasil PCR menghasilkan pita spesifik 600 bp. Amplikon dipotong menggunakan enzim HaeIII dan menghasilkan 4 macam haplotip yang menunjukkan adanya polimorfisme. Haplotip pertama yaitu fragmen DNA dengan ukuran 300 bp, haplotip kedua hasil amplifikasi yang terpotong oleh enzim restriksi menjadi 2 fragmen dengan ukuran 150 bp, dan 300 bp. Haplotip ketiga terdiri dari 3 fragmen dengan ukuran 100 bp, 150bp, dan 300 bp. Haplotip keempat terdiri dari 4 fragmen dengan ukuran 100 bp, 150 bp, 300 bp, dan 400 bp