Trichophyton rubrum'um trichophyton mentagrophytes'ten ayırt edilmesinde kullanılan tanı testlerinin karşılaştırılması

TEZ6482Tez (Yüksek Lisans) -- Çukurova Üniversitesi, Adana, 2007.Kaynakça (s.76-81) var.xiv, 82 s. : rnk.res. ; 29 cm.Nowadays a rapid and striking change is observed in the taxonomy of dermatophytes. They are either re-grouped or re-named, in addition some varieties remain out of nomenclature giving origin to new species. The gold standard in laboratory diagnosis is sequencing analysis. But dermatophyte species are identified at the level of species according to colony characteristics, microscopic morphologies, growth requirements, physiological and biochemical characteristics due to infer-structural needs and high cost of molecular based researches. As changes are observed for a single dermatophyte species both for its morphology (colony pattern, pigments and growth rate) or physiology (in vitro hair perforation) and for its genotype (rRNA and mating patterns); the reliability of the method is questioned. Many micro-organisms belonging to Trichophyton rubrum complex are renamed i.e., T. fischeri, T. kanei, T. raubitschekii and similar are identified. Trichophyton interdigitale, and other micro-organisms pertaining to Trichophyton mentagrophytes sensu lato are re-classified by sequencing analysis. But one of the principal problems observed in mycology laboratory is the differentiation of T. rubrum from T. mentagrophytes using classical diagnostic methods. This study aimed to discuss the efficacy of morphological, physiological and biochemical diagnostic tests used in the laboratory identification of micro-organisms pertaining to both complexes before the current classification, in addition to interrogate their reliability in routine laboratory practice.Günümüzde, dermatofitlerin taksonomisinde hızlı ve çarpıcı bir değişim yaşanmaktadır. Dermatofitler ya yeniden gruplandırılmakta ya da yeniden isimlendirilmekte, ayrıca çeşitli türlere ilişkin varyete isimleri terk edilip yeni bir tür şeklinde sınıflandırılmaktadır. Laboratuvar tanıda altın standart yöntem dizi analizidir. Ancak, moleküler temelli araştırmaların gerek alt yapı gereksinimi ve gerekse yüksek maliyeti nedeni ile dermatofit türleri; koloni özellikleri, mikroskop morfolojileri, büyüme gereksinimleri, fizyolojik ve biyokimyasal özelliklerine göre tür düzeyinde tanılanmaktadır. Aynı dermatofit türünün gerek morfoloji (koloni örgüsü, pigment ve üreme hızı) ve fizyolojisinde (kıl delme) ve gerekse genotiplerinde (rRNA ve mating şekilleri) değişimler görülmekte ve anılan yöntemlerin güvenilirliği sorgulanmaktadır. Trichophyton rubrum kompleks içerisinde yer alan bir çok mikroorganizma da yeniden isimlendirilmiş; T. fischeri, T. kanei, T. raubitschekii ve diğer türler tanınmıştır. Trichophyton mentagrophytes sensu lato içerisinde yer alan T. interdigitale ve diğer mikro-organizmalar da dizi analizi ile yeniden sınıflandırılmıştır. Ancak, mikoloji laboratuvarlarında yaşanan önemli sorunlardan birisi de klasik tanı yöntemleri ile T. rubrum'un T. mentagrophytes'den ayırt edilmesidir. Bu çalışmada, çağdaş sınıflandırmadan önce her iki kompleks içerisinde yer alan mikro-organizmaların laboratuvar tanısında kullanılan morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal tanı testlerinin etkinliğinin tartışılması amaçlanmış, ayrıca rutin laboratuar uygulamalarındaki güvenilirliği sorgulanmıştır.Bu çalışma Ç.Ü. Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi Tarafından Desteklenmiştir. Proje No:TF2004D