Türkiye'de yetiştirilen gökkuşağı alabalıklarından izole edilen Chrysobacterium türlerinde plazmid aracılı kinolon direnç genlerinin belirlenmesi

Sucul ortam, hem antibiyotik direnç genlerinin doğal birrezervuarı hem de bakteri ve antimikrobiyal direnç genlerinin çevreye yayılmasıaçısından öneme sahiptir. Plazmid aracılı kinolon direnci (PMQR) insan ve hayvan enfeksiyonlarınıntedavisinde kinolonların etkinliğini  sınırlayanönemli bir faktördür. Bu çalışmada, Türkiye'deki gökkuşağı alabalığıçiftliklerinden izole edilen 70 Chrysobacteriumspp. izolatında PMQR genleri analiz edilmiştir. Chrysobacterium spp. izolatları 16S rRNA sekans analizi ile identifiyeedilmiştir. İzolatların kinolonduyarlılığı oksolinik aside karşı minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) yöntemikullanılarak belirlendi ve PMQR genlerinin (qnrA,qnrB, qnrS) varlığı ise PCR ile incelenmiştir. Deri renginin koyulaşmasıve egzoftalmus gibi klinik belirtiler gösteren gökkuşağı alabalıklarından izoleedilen izolatlar C. aquaticum olaraktanımlandı. Yapılan MİK testi ile izolatların %89’unun oksolinik asite duyarlılığınınazaldığı belirlenmiştir. qnrA geni barındıran28 (% 40) izolat, qnrS barındırılan23 izolat (% 32) ve hem qnrA hem de qnrS barındıran 17 izolat (% 24) tespitedilmiştir. Hiçbir izolatınqnrB geni barındırmadığı tespit edilmiştir. Bulgularımız, C. aquaticum izolatlarında yüksek orandakinolon direnci (% 89) ve PMQR genleri bulunduğunu göstermiştir. Çalışmamız PMQRgenleri açısından C. aquaticum'unpotansiyel olarak su ortamında rezervuar görevi yapabileceğini ve sudaki diğer bakteriyeltürler arasında horizantal gen transferinin olası olduğunu vurgulamaktadır.Anahtar Kelimeler: PMQR, C. aquaticum,Gökkuşağı Alabalığı, Antimikrobiyal DirençBu çalışma Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Fonu tarafındanTCD-2018-8586 proje no ile desteklenmiştir. The aquatic environment can serve both as a natural reservoir of antibiotic resistance genes and the spreading of bacteria and antimicrobial resistance genes to environment. Plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) genes represent an important challenge to the effectiveness of quinolones in the treatment of human and animal infections. In this study, 70 Chrysobacterium spp. isolates recovered from farmed rainbow trout in Turkey were analyzed for PMQR genes. Chrysobacterium spp. strains were identified with 16S rRNA sequence analysis. Quinolone susceptibility among the strains was determined using minimum inhibitory concentration method against oxolinic acid, and the frequency of PMQR genes (qnrA, qnrB, qnrS) was investigated by PCR. The isolates recovered from farmed rainbow trout exhibiting clinical signs such as darkening of skin color, exophthalmia were identified as C. aquaticum. The rates of reduced susceptibility in phenotypically were determined for oxolinic acid (89%). Of the 70 isolates, 28 (40%) isolates harbored qnrA, 23 isolates (32%) harbored qnrS and 17 isolates (24%) have both qnrA and qnrS. None of the isolates harbored qnrB. Our findings showed high rates of quinolone resistance (89%) and qnr genes, underlining the importance of aquatic environment as reservoirs for the dissemination of potentially possible C. aquaticum and horizontal gene transfer between other waterborne bacterial species. Keywords: PMQR, C. aquaticum, Rainbow Trout, Antimicrobial ResistanceThis research was supported by The Research Fund of Erciyes University. Project Number: TCD-2018-8586.