Ege Bölgesi bağ alanlarında viroidlerin belirlenmesi üzerinde çalışmalar

Bu çalışmada, Ege Bölgesi bağ alanlarında bulunan bağ viroidlerinin RT-PCR yöntemiyle belirlenmesi ve bağlarda yaygınlık oranlarının saptanmasına yönelik araştırmalar yapılmıştır. Çalışmada, Ege Bölgesi'nde bağcılığın yoğun olarak yapıldığı Manisa, İzmir ve Aydın il ve ilçelerinin bağ alanlarında, sörveyler düzenlenerek 52 farklı üzüm çeşidinden 190 örnek toplanmıştır. Bunlardan, 54 adedinin bir veya birden fazla viroid ile enfekteli olduğu, 126 adedinin ise herhangi bir viroid içermediği tespit edilmiştir. RT-PCR yöntemiyle yapılan çalışmalarda, alınan örneklerin GYSVd-1, GYSVd-2, HSVd-g ve CEVd-g ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. RT-PCR analizi sonuçlarına göre; toplanan 190 adet bağ örneğinin, %28,42'sinin bir ya da birden fazla viroid ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Etmenleri araştırmak amacıyla yürütülen RT-PCR analiz çalışmasında, 5 örnekte GYSVd-1 ve GYSVd-2'nin viroid bantları saptanmıştır. RT-PCR analizi sonuçlarına göre, testlenen 190 örneğin; %4,74'ünün sadece GYSVd-1, %4,21'inin GYSVd-2, %9,47'sinin CEVd-g, %4,21'inin HSVd-g ve %2,11'inin ise hem GYSVd-1 hem de GYSVd-2 ile bulaşık olduğu tespit edilmiştir.RT-PCR çalışmaları sonucunda, GYSVd-1, GYSVd-2, CEVd-g ve HSVd-g'nin varlığı agar jel üzerinde belirlenmiştir. Bu viroidlerin nükleotid dizilim analizleri sonucunda GYSVd-1'in 366 nükleotid, GYSVd-2'nin ise 363 nükleotid, CEVd-g'nin 369 nükleotid ve HSVd-g'nin 297 nükleotid içerdiği bulunmuştur