Türkiye’de Enginarda Artichoke latent virüsü (ArLV)’nün Yeni Bildirimi

Son yıllarda Ege Bölgesi’ndeki bazı enginar üreticilerinin tarlalarındaki enginar bitkilerinde (Cynara cardunculus L. subsp. scolymus (L.) Hayek) virüs benzeri belirtiler olduğunu belirtmeleri üzerine, enginar bitkilerindeenfeksiyon oluşturan virüslerin tanılanması için Nisan 2011 ve Mart 2012tarihleri arasında bir survey çalışması yürütülmüş ve Türkiye enginar üretiminin%30’dan fazlasının sağlandığı üretim alanlarından toplam 50 örnek alınmıştır.Alınan örnekler DAS-ELISA, RT-PCR ve biyolojik indeksleme yöntemleri kullanılarak Artichoke latent virus (ArLV), Tobacco mosaic virus (TMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Broad bean wilt virus (BBWV) ve Raspberry ringspot virus (RpRSV) varlığı açısından testlenmiştir.Testlenen tüm örneklerde TMV, TSWV, BBWV ve RpRSV enfeksiyonlarının olmadığı tespit edilmiştir. RT-PCR çalışmalarında virüs benzeri belirtiler gösteren 35 örneğin 9’unda 282 bp’de ArLV amplikonları elde edilmiştir. Sekanslanan 9 PCR ürünü (Accession No: KC622053) ile yürütülen BlastN analizlerinde “Artichoke latent virüs mRNA unknown function (GenBank Accession No:X87255.1)” izolatı ile % 86 oranında benzerlik olduğu bulunmuştur. Ayrıca, RT-PCR çalışmalarında bu virüs ile enfekteli oldukları saptanan örnekler kullanılarak yapılan mekanik inokulasyon sonucunda, bazı test bitkilerinde ArLV enfeksiyonuna özgü tipik simptomların ortaya çıktığı görülmüştür. Mevcut bilgilerimize göre, bu çalışmadaki bulgular Türkiye’de enginar bitkilerinde ArLV’nin doğal enfeksiyonunun güncel durumunu yansıtan kayıt niteliğindedir.In recent years, some of artichoke growers in Aegean region of Turkey stated that globe artichoke (Cynara cardunculus L. subsp. scolymus (L.) Hayek) plants in their fields have showed virus-like symptoms. So, in order to identify viruses infecting globe artichoke, a survey was conducted between April 2011 and March 2012 and totally 50 globe artichoke samples were collected from the production areas in the mentioned region from which was provided more than 30 % of total globe artichoke production in Turkey. The samples were analyzed by DAS-ELISA, RT-PCR and biological indexing methods for Artichoke latent virus (ArLV), Tobacco mosaic virus (TMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Broad bean wilt virus (BBWV) and Raspberry ringspot virus (RpRSV). TMV, TSWV, BBWV and RpRSV were not detected in all of samples tested. In RT-PCR, amplicons of the expected size (ca. 282 bp) were obtained from 9 out of 35 symptomatic plant samples bearing virus-like symptoms. The amplified and sequenced 9 PCR products (Accession No: KC622053) showed 86 % nucleotide sequence identity with “Artichoke latent virus mRNA unknown function (GenBank Accession No:X87255.1)” isolate in BlastN analysis. Moreover, when mechanically inoculated with the sap from plant samples, that were positive for ArLV in RT-PCR, selected test plants produced the typical symptoms of ArLV infection. As to the result of the literature review on the topic in question, this is the latest report of natural ArLV infection from globe artichoke in Turkey