Biyomoleküllerin elektrokimyasal biyosensörler ile algılanması

Bu çalışmada, biyomolekülerin DNA düzeyinde algılanmasına yönelik kuantum parçacıkları işaretli bir genosensör tasarımı yapılmıştır. Tasarımı yapılan genosensörde E. coli bakterisine ait uzun PCR ürünü model olarak kullanılmış ve sandviç hibridizasyon yöntemi ile çift hibridizasyonun algılanması yönelik analizler gerçekleştirilmiştir. Çalışmada sensör yüzeyi olarak tek kullanımlık grafit elektrotlar kullanılmıştır. E. coli bakterisinin tanımlanmasında biri yakalayıcı biri kuantum parçacıkları ile işaretli olan sinyal verici prob olmak üzere 2 farklı prob dizi tasarlanmıştır. Aynı zamanda çalışmada diferansiyel puls voltametresi ölçüm tekniği olarak kullanılmıştır. Çalımada, sensör yüzeyine bağlanan yakalaycı prob dizi ile denatüre edilmiş E. coli PCR ürünü arasında oluşan hibrit yapı kuantum parçacığı ile işaretli olan sinyal verici prob ile ikinci bir hibridizasyona tabi tutulmuştur. Hibridizasyonun algılanması, kuantum parçacığının çekirdeğindeki kadminyum içerğinin -0.8V'da verdiği yükseltgenme sinyaline dayalı olarak gerçekleştirilmiştir. Tasarlanan genosensörün seçiciliği, biri E. coli yerine kullanılan L. monocytogenes amplikonu diğeri ise sinyal verici prob yerine M. tuberculosise ait prob dizi olmak üzere 2 tüm bazları hedeften farklı molekül kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Tez çalışması kapsamında E. coli bakterisinin klinik alanda algılanmasına yönelik tasarlanan genosensörün prob& hedef dizi konsantrasyonları, hibridizasyon & yıkama tamponları ve yıkama zamanı gibi parametreler incelenerek optimizasyon çalışmaları gerçekleştirilmiş. Bunların sonucunda elde edilen veriler doğrultusunda yapılan analizlerde tayin sınırı 1.13 pmol olarak saptanmıştır