Baharatlarda Escherichia Coli 0157:H7’nin aranmasında klasik mikrobiyolojik yöntemler ile Real-Time PCR yönteminin karşılaştırılması

İzmir’de bir sterilizasyon firmasından alınan 66 farklı baharat örneği (15 kimyon, 10 kekik, 5 biberiye, 9 kişniş, 8 anason, 5 defne, 6 rezene, 8 adaçayı) analiz edilmiştir. Bunun yanı sıra toplam mikrobiyal yükün bilinmesi açısından aerobik mezofilik bakteri, küf-maya, koliform grubu bakteriler, fekal koliform, Bacillus sp. sayımları yapılmış ve Salmonella sp. varlığına bakılmıştır. Sonuç olarak bütün örneklerde toplamda Bacillus sp. sayısı 9,9 x101 kob/g ile 1,6 x 102 kob/g, aerobik mezofilik bakterilerin sayıları 5,1x103 kob/g ile 2,0x108 kob/g, küf-maya sayıları 1,1x102 kob/g ile 1,2 x 104 kob/g, koliform sayısı bütün örnekler için ortalama 7,8 x 102 kob/g olarak bulunmuştur. Yapılan analizlerde her iki yöntem ile 66 farklı örneğin hiçbirisinde E.coli O157:H7 ve Salmonella belirlenmemiştir. E. coli O157:H7 için uygulanan klasik yöntem 4-5 gün sürerken Real-Time PCR ile yapılan yöntemde ön zenginleştirme dahil yaklaşık 18 saat sürmüştür. Ayrıca klasik yöntemde pozitif gibi görünen sonuçlar latex aglütinasyon testi uygulandığında negatif sonuç vermiştir. Bu durumda, klasik yöntemin kesinliği şüphe uyandırmaktadır ve alternatif yöntem olarak Real-Time PCR düşünülebilir