Farklı zeytin çeşitlerinde kloroplast genomu bazı genlerinde indel polimorfizmlerin saptanması

Bu çalışmada Zeytincilik Araştırma Enstitüsünden temin edilen Edremit (Ayvalık) ve Memecik kültür çeşitleri ile Mordoğan ve civarında yayılış gösteren ve Delice olarak bilinen zeytin genotiplerde kloroplast genleri ycf1, ycf3 ve OetrnS- trnG'de indel polimorfizmler araştırılmıştır. Edremit kültür çeşidi kuraklığa duyarlı; Memecik kültür çeşidi kuraklığa dirençli olduğu bilinen kültür çeşitleridir ve ülkemizde yaygın olarak yetiştirilmektedir. Kloroplast genomu maternal kalıtım gösterdiğinden kültür içi ayrımda kullanılmaktadır. Daha önceki çalışmalarda polimorfik olduğu saptanan kloroplast genlerinden ycf1, ycf3 ve OetrnS- trnG genleri polimorfizm özellikleri doğrudan sekans analizleri yapılarak çalışılmıştır. NCBI/BLAST karşılaştırma sonuçlarıyla belirlenen polimorfizmler, genel olarak bu genlerle ilgili 4 ana grubu ortaya koymaktadır. Fakat bu gruplandırma, anlamlı filogenetik veya filocoğrafik veriler ortaya koymamaktadır. Bunun dışında bireyler arasında Oe-trnS-trnG geni için Edremit çeşidi bireylerinde, ycf1 geninde Delice genotipinde, ycf3 geninde yine Delice genotipi bireylerinde baz değişim ve tek baz delesyon polimorfizmleri belirlenmiştir. Saptanan bu polimorfizmler, bireyler arası bir ayrımı ortaya koyarken, araştırılan genotipler ve genotiplerin karakteristik özelliklerine yönelik anlamlı bir farkı belirtmemektedir