Détection de différence de densité de marqueurs fluorescents en microscopie superrésolue : approche pointilliste ou texturale ?

National audienceNous considérons le problème de l'estimation de densité de marqueurs fluorescents dans des cellules uniques imagées en microscopie superrésolue. Cette problématique est importante en bioimagerie où la densité de ces marqueurs peut traduire l'état sain ou pathologique des cellules, l'organisation spatiale de l'ADN, ou encore l'état dans le cycle de la division cellulaire. Avec les nouvelles microscopies superrésolues et les circuits de microfluidiques associés, il est possible de détecter au sein de cellules uniques les biomarqueurs individuellement ou collectivement sous la forme d'une texture suivant la qualité de la réponse impulsionnelle du microscope. Dans ce travail, nous proposons d'étudier la question de la détection de la différence de densité suivant une approche individuelle (pointilliste) ou collective (texturale) en comparant les performances en fonction de la taille de la réponse impulsionnelle. Abstract-We consider the problem of of fluorescent marker density estimation in single cells imaged by superresolved microscopy. This problem is important in bioimaging since the density of these markers can reflect the healthy or pathological state of cells, the spatial organization of DNA, or the state in the cycle of cell division. With the new superresolved microscopes and associated microfluidic devices, biomarkers can be detected in single cells individually or collectively as a texture depending on the quality of the microscope impulse response. In this work, we propose to adress the question of density difference detection according to an individual (pointillist) or collective (textural) approach by comparing the performances according to the size of the impulse response