ELUCIDANDO LA RELACIÓN ENTRE LA MICROBIOTA RUMINAL Y LA EMISIÓN DE GASES DE EFECTO INVERNADERO MEDIANTE LA APLICACIÓN DE LA GENÓMICA

Given the digestive nature of ruminants, these animals have evolved to obtain nutrients from lignocellulosic substrates, particularly butyrate, propionate and acetate as byproducts from the degradation of plant tissues due to the action of the ruminal microbial consortia. This microbiome is composed by bacteria, archaea, fungi and protozoa which thrive in an anoxic habitat and, although beneficial to the ruminant, produce the highest amounts of methane derived from livestock production activities. Several studies and treatments have focused in diminishing ruminal methane emissions; however, as of today there is not a viable method established that reduces the impact of livestock on climate change. This in part due to the lack of knowledge of the ruminal microbiome given the difficulty to isolate and grow these organisms in vitro conditions. Today, genomic tools allow the study of microbial consortia without the need to isolate the microorganisms. The use of metagenomics has described the ruminal microbiome structure, as well as the intrinsic and external factors that modify it. However, to understand the physiological function and activity of the microbial taxas, it will be necessary to employ other genomic tools in order to attain a holistic view of the ruminal microbiota and with that, to establish strategies that allow decreasing the generation of greenhouse gases.Dada la naturaleza digestiva de los rumiantes, estos animales han evolucionado para obtener nutrientes a partir de substratos lignocelulolíticos, particularmente butirato, propionato y acetato, los cuales son los productos de degradación del tejido vegetal por acción del consorcio microbiano que habita en el rumen. Esta microbiota constituida por bacterias, arqueas, hongos y protozoarios se desarrolla en un ambiente anóxico y aunque benéfica para el animal, produce una de las mayores cantidades de metano de la actividad pecuaria. Diversos estudios y tratamientos se han enfocado en abatir la generación de metano ruminal; sin embargo, a la fecha no hay un método viable establecido que disminuya el impacto que genera la actividad ganadera en el cambio climático. El desconocimiento de la comunidad microbiana del rumen, dada su dificultad para aislarlos y cultivarlos in vitro, es una de las causas de lo anterior. Actualmente las herramientas genómicas permiten estudiar los consorcios microbianos en ambientes complejos sin la necesidad de aislar a los microorganismos. La aplicación de la metagenómica ha permitido una vasta descripción de la estructura del microbioma ruminal, así como los factores intrínsecos y extrínsecos que la modifican. No obstante, no basta determinar las taxas microbianas del rumen para comprender su función y actividad fisiológica; para ello será necesario el uso de las otras herramientas genómicas que permitan obtener una visión holística de la microbiota ruminal y con ello establecer estrategias que permitan abatir la generación de gases efecto invernadero