Genetic Stock Identification and Relative Contribution of Arctic Char (Salvelinus alpinus) from the Hornaday and Brock Rivers to Subsistence Fisheries in Darnley Bay, Northwest Territories + Supplementary Appendix Tables S1 to S4 (See Article Tools)

Where anadromous fishes occur in the Canadian Arctic, they provide the mainstay of local subsistence fisheries of varying intensities. Many of these fisheries harvest a mixture of stocks at discrete locations and it is often not known which stocks, specifically, are being harvested and to what extent. In the Darnley Bay area of the Northwest Territories, Arctic char, Salvelinus alpinus, in particular have long provided an important subsistence resource to residents of Paulatuk, and char from two systems (the Hornaday and Brock Rivers) are thought to contribute to the coastal fishery for this species. Genetic mixed-stock analysis (GMA) is routinely applied for resolving stock contributions to such fisheries, yet studies incorporating GMA to understand specifically which stocks are being harvested in the Canadian Arctic, and to what extent, are relatively scarce. In this study, we assayed microsatellite DNA variation among 987 Arctic char from two important coastal subsistence fisheries and several inland sampling locations in the Darnley Bay area to (1) assess the degree of genetic structuring between the Hornaday and Brock Rivers and (2) resolve the proportional contributions of these stocks to coastal mixed-stock fisheries in the region using GMA. Overall, genetic differentiation was relatively high and significant (θ = 0.117; 95% C.I. = 0.097–0.142) among baseline sampling locations. Overall patterns of genetic stock structure also support previous hypotheses that additional life history types (e.g., landlocked or freshwater-resident char, or both) exist in the Hornaday system, as indicated by elevated levels of genetic differentiation between some of our sampling locations. The GMA suggested that, while both river systems contribute to the coastal fishery, catches were dominated by Arctic char from the Hornaday River, which highlights the importance of this system. All told, our results may be relevant to the management of the subsistence fishery in Darnley Bay and for furthering the collective understanding of char biodiversity and life history variation in the Canadian Arctic.Dans les milieux de l’Arctique canadien où l’on trouve des poissons anadromes, ceux-ci sont à la base de pêcheries de subsistance locales d’intensités variées. Grand nombre de ces pêcheries permettent de récolter un mélange de stocks à différents endroits et nous ne savons souvent pas quels stocks en particulier sont récoltés et jusqu’à quel point. Dans la région de la baie Darnley, dans les Territoires du Nord-Ouest, l’omble chevalier, Salvelinus alpinus, en particulier, a longtemps fourni une ressource de subsistance importante aux résidents de Paulatuk, et des ombles de deux réseaux (les rivières Hornaday et Brock) semblent contribuer à la pêche de cette espèce en eaux côtières. La méthode de l’analyse génétique de stocks mélangés est souvent employée pour déterminer les contributions de différents stocks à ce genre de pêcheries, mais relativement peu d’études intégrant l’analyse génétique de stocks mélangés ont été réalisées pour comprendre exactement quels stocks sont récoltés dans l’Arctique canadien, et jusqu’à quel point. Dans cette étude, nous avons analysé des variations d’ADN microsatellite chez 987 ombles chevaliers de deux importantes pêcheries de subsistance côtières et plusieurs sites d’échantillonnage intérieurs dans la région de la baie Darnley pour 1) évaluer le degré de structuration génétique entre les rivières Hornaday et Brock et 2) déterminer les contributions proportionnelles de ces stocks par rapport aux pêches côtières de stocks mélangés dans la région au moyen de l’analyse génétique de stocks mélangés. Dans l’ensemble, la différenciation génétique était relativement élevée et significative (θ = 0,117; IC à 95 % = 0,097–0,142) parmi les sites d’échantillonnage de base. Les tendances générales relatives à la structure génétique des stocks appuient également des hypothèses antérieures selon lesquelles d’autres types de cycles de vie (p. ex. l’omble confiné aux eaux intérieures ou l’omble d’eau douce, ou les deux) existent dans le réseau Hornaday, tel qu’indiqué par les niveaux élevés de différenciation génétique entre certains de nos sites d’échantillonnage. L’analyse génétique des stocks mélangés suggère que, bien que les réseaux des deux rivières contribuent à la pêche côtière, l’omble chevalier de la rivière Hornaday dominait les prises, ce qui met en évidence l’importance de ce réseau. Dans l’ensemble, nos résultats peuvent être pertinents pour la gestion de la pêche de subsistance dans la baie Darnley et pour favoriser la compréhension collective de la biodiversité de l’omble et de la variation de son cycle vital dans l’Arctique canadien