Molecular epidemiology of small single-stranded DNA viruses

Il Carnivore protoparvovirus 1 ed il Canine circovirus (CanineCV) sono due piccoli virus con un genoma a singola molecola di DNA monocatenario, che conferisce loro una notevole tendenza a mutare. Se il ruolo patogeno del Carnivore protoparvovirus 1 è ben noto, quello del CanineCV non è stato ancora del tutto definito. Nel primo studio è stato ricercato il DNA del virus della panleucopenia felina (FPV) e del parvovirus canino tipo 2 (CPV-2) nel buffy-coat di una popolazione di gatti, successivamente è stata valutata l’immunità umorale nei confronti del parvovirus nei soggetti risultati positivi. I virus identificati sono stati, inoltre, molecolarmente caratterizzati. Il DNA del FPV e del CPV-2 è stato rilevato anche in gatti sani con titoli anticorpali considerati proteggenti, facendo supporre che il gatto possa rivestire un ruolo importante nell’epidemiologia dei parvovirus. Nel secondo studio è stato sviluppato un saggio molecolare in grado di rilevare i CanineCV circolanti nei canidi domestici e selvatici. Successivamente, tale saggio di Real-Time PCR è stato impiegato per determinare la prevalenza dell’infezione da CanineCV in cani affetti da parvovirosi; sono stati poi messi a confronto i dati clinici e clinico-patologici dei soggetti che presentavano una co-infezione da CanineCV e CPV-2 rispetto a quelli infetti dal solo CPV-2. Non essendo state evidenziate differenze statisticamente significative tra i due gruppi, l’effettivo ruolo patogeno del CPV-2 risulta tuttora incerto. Il saggio molecolare è stato inoltre utilizzato per indagare l’eventuale circolazione del CanineCV in una popolazione di volpi rosse italiane; le sequenze nucleotidiche genomiche dei virus identificati sono state poi caratterizzate ed analizzate filogeneticamente. In questo studio è stata identificata, per la prima volta in Italia, una volpe rossa infetta da un CanineCV. Il virus mostrava caratteristiche genetiche più simili ai CanineCV circolanti nei cani, suggerendo una possibile trasmissione del virus tra le due specie.Carnivore protoparvovirus 1 and Canine circovirus are two small viruses with a genome formed by one molecule of single-strand DNA; this feature gives these viruses a great tendency to evolve. While the pathogenic role of Carnivore protoparvovirus 1 variants is well known, that of Canine circovirus (CanineCV) remains still unclear. In the first study, the presence of DNA of feline panleukemia virus (FPV) and canine parvovirus 2 (CPV-2) in the buffy-coat of a population of cats was investigated. Then the humoral immunity against parvovirus was evaluated in the positive subjects. The identified viruses were successively molecularly characterized. DNA of FPV and CPV-2 was identified in buffy-coats of healthy cats, despite antibody titers considered protective; this suggests that cats can play an important role in the epidemiology of parvovirus infections. In the second study a molecular assay able to detect the circoviruses circulating both in domestic and wild canids was developed. Successively, the Real-Time PCR assay previously developed was used to determine the prevalence of the CanineCV infections in dogs with parvovirosis; the clinical and clinical-pathological data was then compared between subjects affected both by CanineCV and CPV-2 and subjects affected by CPV-2 only. No statistical differences were found between the two groups, and the effective pathogenic role of CPV-2 is still unclear. The same Real-Time PCR assay was also used to investigate the circulation of CanineCV in a population of Italian red foxes; the genomic nucleotide sequences of the identified viruses were then characterized and phylogenetically analyzed. This study identified, for the first time in Italy, a red fox infected by a CanineCV with genetic characteristics more similar to those circulating in dogs (compared to those circulating in the foxes), suggesting a possible transmission of the virus between the two host species