Caracterização do viroma fecal de frangos de corte saudáveis e afetados pela síndrome da má absorção

A síndrome da má absorção (SMA) é uma doença de aves jovens caracterizada por retardo no crescimento, desenvolvimento defeituoso das penas e diarreia, resultando em relevante impacto econômico. Estudos prévios têm investigado a participação de uma série de agentes virais na etiologia da SMA. No entanto, o conhecimento limitado da comunidade viral presente no intestino das aves dificulta a identificação precisa do(s) agente(s) causal(is). Nesse sentido, o presente estudo foi conduzido visando ampliar o conhecimento sobre o viroma entérico de frangos de corte jovens (3-5 semanas) e seu envolvimento com a ocorrência da SMA. Para tanto, em quatro granjas, foram feitas coletas de conteúdo intestinal de frangos clinicamente saudáveis. DNA e RNA virais foram extraídos, sequenciados e comparados com dados previamente disponíveis através de análises metagenômicas. Genomas representantivos de uma ampla diversidade de reconhecidas famílias virais (Adenoviridae, Caliciviridae, Circoviridae, Parvoviridae, Picobirnaviridae, Picornaviridae e Reoviridae) foram identificados. Igualmente, foram detectados vários agentes não previamente descritos, com genomas de DNA fita simples circular, presentemente denominados vírus “CRESS-DNA”. Numa etapa seguinte, foi conduzido um estudo visando examinar comparativamente o viroma entérico de frangos de corte afetados pela SMA (n=35) e frangos saudáveis (n=35). Foram detectados genomas de membros das seguintes famílias virais:Picornaviridae, vírus CRESS-DNA, Circoviridae, Anelloviridae, Reoviridae, Picobirnaviridae, Astroviridae, Caliciviridae, Parvoviridae e Adenoviridae. A comparação entre a distribuição do número de reads correspondentes as diferentes espécies de vírus eucarióticos identificados no grupo de aves doentes e de aves saudáveis não apresentou diferença estatística. Esses resultados sugerem que a causa da SMA não está relacionada à infecção por um agente viral específico. Futuros estudos são necessários para elucidar a etiologia desta síndrome em frangos de corte.Malabsorption syndrome (MAS) is a disease of young broilers characterized by growth retardation, defective feather development and diarrhea with undigested food, resulting in relevant economic impact. Previous studies have investigated the involvement of a number of viral agents in the MAS etiology. However, the limited knowledge of the viral community in poultry gut hinders identification of a particular causative agent(s). In this sense, the present study was conducted aiming to increase the knowledge about the enteric virome of young broiler chickens (3-5 weeks) and its potencial involvement in the occurrence of MAS. For this purpose, on four poultry farms, intestinal contents were collected from clinically healthy chickens. Viral DNA and RNA were extracted, sequenced and compared with previously available data through metagenomic analyzes. Genomes representing a wide diversity of recognized viral families (Adenoviridae, Caliciviridae, Circoviridae, Parvoviridae, Picobirnaviridae, Picornaviridae e Reoviridae) were identified. Also, several agents not previously described were detected, with single-stranded circular DNA genomes, presently known as viruses “CRESS-DNA”. In a subsequent step, a study was conducted comparing the enteric virome of broilers affected by MAS (n = 35) and healthy broilers (n = 35). Genomes of members of the following viral families were detected: Picornaviridae, virus CRESS-DNA, Circoviridae, Anelloviridae, Reoviridae, Picobirnaviridae, Astroviridae, Caliciviridae, Parvoviridae e Adenoviridae. Comparison between the distribution of sequences reads matching different species of eukaryotic virus identified in the group of diseased birds and healthy birds did not reach statistical difference. These results suggest the cause of SMA is not related to infection by a specific viral agent. Future studies are needed to elucidate the etiology of this syndrome in broiler chickens