Valutazione del sistema Cepheid Gene Xpert MTB/RIF in campioni respiratori e non respiratori per la diagnosi rapida di tubercolosi

Introduzione: il sistema GeneXpert MTB/RIF (Cepheid, USA), una Real-Time PCR che identifica Myc. tuberculosis (MTB) e la resistenza alla Rifampicina direttamente da campioni clinici, è stato introdotto nella routine diagnostica del laboratorio di Microbiologia del Policlinico S. Orsola-Malpighi di Bologna da 6 mesi. Scopo del lavoro è stato valutare questa nuova tecnologia nella diagnosi di tubercolosi polmonare ed extrapolmonare, in confronto alla coltura. Metodi: sono stati sottoposti al test GeneXpert 545 campioni pervenuti al laboratorio di Microbiologia nel periodo gennaio-giugno 2011 per la ricerca di micobatteri. Su ciascun campione sono stati eseguiti l’esame microscopico e colturale e, in caso di coltura positiva per MTB, il test di sensibilità ai farmaci antitubercolari di prima linea. Risultati: i campioni analizzati erano suddivisi in 323 (59,3%) respiratori, ovvero espettorati, broncolavaggi, lavaggi bronco-alveolari, e 222 (40,7%) non respiratori, rappresentati da linfonodi, biopsie, liquidi pleurici, aspirati gastrici, materiali purulenti, urine, liquidi cefalorachidiani. Su 545 campioni, 68 sono risultati positivi alla coltura con un “agreement” del 75% con il sistema GeneXpert, rispettivamente dell’83,3% per i materiali respiratori e del 61,5% per quelli non respiratori. Per i campioni microscopico-positivi l’”agreement” è risultato del 100%. La sensibilità del test GeneXpert è risultata dell’84,4% quando eseguito su campioni respiratori e del 67,7% su quelli non respiratori, con una sensibilità sul totale dei campioni del 77,6%. In particolare, sono risultati positivi alla coltura ma PCR-negativi rispettivamente 7 (2,2%) campioni respiratori e 10 (4,5%) materiali non respiratori. In entrambi i gruppi di materiali la specificità è stata del 100% e in 8 casi la conferma microbiologica della diagnosi clinica di tubercolosi è stata posta esclusivamente dalla positività alla PCR. La resistenza molecolare alla Rifampicina è stata rilevata in 7 campioni, confermata dalla resistenza fenotipica, con un ”agreement” del 100%. Conclusioni: i dati ottenuti dimostrano l’efficacia del sistema GeneXpert nella diagnosi rapida di tubercolosi e nella sua capacità di rilevare la resistenza alla Rifampicina nella realtà bolognese, considerata a bassa endemia tubercolare