ANÁLISIS FILOGENÉTICO DE LA DIVERSIDAD BACTERIANA ASOCIADA A LA RIZÓSFERA DE PLANTAS DE TRIGO (Triticum aestivum L.)

El estudio del suelo se considera enorme ya que este alberga una gran diversidad genética microbiana. En particular, la porción de suelo que rodea a la raíz vegetal se le conoce como rizósfera y es aquí donde existen diferentes interacciones entre los microorganismos y la planta. La composición de la comunidad microbiana, y en particular las bacterias de la rizósfera puede verse influenciada por diversos factores bióticos y abióticos. Se sabe que las bacterias juegan diversos papeles ecológicos dentro de este ecosistema, en muchos casos promoviendo el desarrollo vegetal y/o controlando el crecimiento de fitopatógenos. Sin embargo, el conocimiento de las interacciones bacteria-planta es aún limitado, más aún el estudio de aquellas bacterias que no se pueden cultivar en el laboratorio. Es por ello importante conocer la diversidad y el papel ecológico que juegan las bacterias cultivables y no cultivables en la rizósfera. En este trabajo, ahondamos en el conocimiento de la diversidad bacteriana cultivable y no cultivable aislada de la rizósfera de plantas de trigo (Triticum aestivum L.) de la comunidad de las Cadenas Municipio de Zamora Michoacán. Para ello, se amplificaron por PCR los genes rARN 16S del metagenoma de la rizósfera y se secuenciaron. Los resultados en búsquedas tipo Blastn mostraron una diversidad principalmente de bacterias cultivables del 79%, mientras que aquellas con similitud a no cultivables fue del 21%. La clases que se identificaron son: gammaproteobacteria con un 37%, betaproteobacteria 16%, actinobacteria 11%, bacilli 11%, alfaproteobacteria 7%, deltaproteobacteria 5%, clostridia 2% y bacterias no cultivables 11%. Dentro de la clase gammaproteobacteria los géneros de Pseudomonas y Stenotrophomonas fueron los más abundantes, ya que componen el 29.41% del total de la biblioteca de genes ribosomales obtenidos. El análisis filogenético mostró que la mayoría de las secuencias ribosomales se agrupan en clados que pertenecen a bacterias rizosféricas. Para conocer que tan diverso es el sistema de estudio, se realizó la prueba de diversidad de Shannon-Wiener, reportando un índice de 3.8 bits por individuo. Lo anterior sugiere que la rizósfera de plantas de trigo alberga una gran diversidad bacteriana que puede jugar importantes papeles ecológicos