Estructura poblacional de aislamiento del Citrus Tristeza Closterovirus (CTV) en México y en Brasil

La tristeza es causada por un complejo viral constituido por diversos haplotipos (hps) del Citrus tristeza virus (CTV). El objetivo fue realizar un análisis de la estructura poblacional en diferentes escenarios epidémicos: a) En Yucatán, México, en condiciones asintomáticas (As) y con presencia de T. citricida (Tc), vector asociado a aislamientos de tipo severo; y en Tamaulipas en condiciones As y sin Tc. b) En Brasil, en condiciones As y sintomáticas (s), en regiones con y sin muerte súbita de los cítricos (MSC), síndrome atribuible a una nueva variante severa del CTV. Se estudiaron las secuencias génicas p25 y p27 de la capa proteica viral. En México, con SSCP se demostró una estructura poblacional compleja en Tamaulipas, con 7 patrones electroforéticos (pes) de hasta 3 hps. Las frecuencias de pes demostraron la existencia de uno prevalente distintivo por región. En Yucatán, los pes se mantuvieron en 2003, 2004 y 2006 en árboles inicialmente positivos (autoinfección) pero con cambios en los nuevos árboles infectados (aloinfección). La mayor variabilidad de las poblaciones del virus fue dentro (69%) que entre regiones (31%). La incidencia de tristeza del 2003-06 en Yucatán fue de 4.41 a 39.33%. La dispersión evidenció un comportamiento agregado (I. Lloyd: 1.54 a 2.39). En Brasil, con SSCP el número pes fue de 12 de hasta 5 y 7 hsp de CTV en regiones con y sin MSC. La mayor variabilidad fue dentro de la población del virus de una misma localidad (98%) que entre localidades (2%), independiente de MSC. No se determinó la asociación de aislamientos de CTV de tipo severo con la MSC. La estructura poblacional del CTV en autoinfección fue mayormente compleja en Brasil, posiblemente por el carácter endémico. Se evidencia por primera vez cambios estructurales en procesos de aloinfeción pero sin una implicación aparente de Tc en el periodo estudiado.________ABSTRACT The tristeza disease is caused by a viral complex constituted by diverse haplotypes (hps) of the Citrus tristeza virus (CTV). The aim was to perform an analysis of the population structure in different epidemics ways: a) In Yucatan, Mexico, with asymptomatic conditions (As) and in presence of Toxoptera citricida (Tc), vector associated with isolates of severe type; and in Tamaulipas under conditions As without Tc.; b) In Brazil, in symptomatic (s) conditions and As, in two regions with and without citrus sudden death (CSD), syndrome attributable to a new severe variant of the CTV. Genes p25 and p27 of the viral capside were studied. In Mexico, with SSCP a complex population structure was found in Tamaulipas, with 7 electrophoretics patterns (eps) of up to 3 hps. The frequencies of eps demonstrated the existence of one prevalent pattern for region. In Yucatan, eps were kept in 2003, 2004 and 2006 in initially positive trees (autoinfection) at it only changed in the new infected trees (aloinfection). The major variability of the populations of the virus was inside (69%) rather than within regions (31%). The incidence of the tristeza from 2003-06 in Yucatan was from 4.41 to 39.33%. The dispersion demonstrated a behavior aggregated (Lloyd´s index: 1.54 to 2.39). The autocorrelation analysis was not conclusive, due the spatial combination of different fruit trees. In Brazil, with SSCP the number eps was of 12 of up to 5 and 7 hsp of CTV in regions with and without CSD. The major variability was inside the population of the virus of the same locality (98%) and not within localities (2%), independently from CSD presence. Therefore, no definite association was found of severe isolations with MSC. The population structure of the CTV in autoinfection was of major complexity in Brazil than in Mexico, possibly due to endemic character. Changes are demonstrated by the first time in the population structure in processes of aloinfection without the apparent implication of Tc in the studied period.Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2008.CONACY