The human gallbladder microbiome is related to the physiological state and the biliary metabolic profile

Trabajo presentado en la 12ª Reunión de la Red Española de Bacterias Lácticas (RedBAL), celebrada en Sevilla (España) del 17 al 18 de mayo de 2018.Y presentado también en el 7th International Human Microbiome Congress, IHMC, celebrado en County Kerry (Irlanda) del 28 al 26 de junio de 2018n los últimos años se está revelando la relación entre el metabolismo de sales biliares y el colesterol, la microbiota intestinal y su implicación en la salud. A diferencia de otras localizaciones, el microbioma del tracto biliar apenas ha sido estudiado. En este trabajo se ha realizado un análisis metagenómico filogenético y funcional de muestras de bilis humana, además de un análisis metabolómico, con el fin de caracterizar el microbioma biliar de donantes de hígado y pacientes con colelitiasis, e identificar posibles disbiosis asociadas a esta patología. Se obtuvieron muestras de bilis de donantes de hígado y pacientes con colelitiasis, de las que se extrajo el ADN biliar siguiendo un protocolo optimizado. Se llevó a cabo la secuenciación masiva de amplicones del ADNr 16S mediante la tecnología Illumina. Además, se realizó secuenciación masiva por shotgun y análisis de metagenómica funcional de tres muestras de bilis de sujetos sanos. El análisis metabolómico se realizó utilizando técnicas de NMR. Los resultados mostraron una gran diversidad microbiana presente en este tipo de muestras, con presencia de 4 filos mayoritarios: Firmicutes, Bacteriodetes, Actinobacteria y Proteobacteria. El análisis estadístico mostró diferencias significativas en la abundancia relativa de diversos taxones presentes en la bilis de ambos grupos. En concreto, secuencias de la familia Propionibacteriaceae fueron más abundantes en la bilis de los donantes de hígado, mientras que en pacientes con colelitiasis fueron más frecuentes las de las familias Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Porphyromonadaceae y Veillonellaceae. El análisis funcional mostró que la asignación a las principales categorías funcionales del COG es similar a la del microbioma intestinal humano. Por último, el análisis metabolómico nos permitió asociar diferentes perfiles metabólicos a los grupos de individuos objeto de estudio.This work was financed by the Spanish “Plan Nacional I+D+i” through the project AGL2013-44761-PPeer reviewe