Microbial metagenomic and metataxonomic study of biliary samples in patients with choleolithiasis and a control group

Trabajo presentado en el 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017), celebrado en Valencia (España), del 9 al 13 de julio de 2017En los últimos años se está revelando la relación entre el metabolismo de sales biliares y el colesterol, la microbiota intestinal y su implicación en la salud. A diferencia de otras localizaciones, el microbioma del tracto biliar apenas ha sido estudiado debido fundamentalmente a la limitación que supone acceder al material biológico. En este trabajo se ha realizado el análisis metagenómico filogenético y funcional de muestras de bilis humana, con el fin de caracterizar el microbioma biliar de sujetos sanos y pacientes con colelitiasis, e identificar posibles disbiosis asociadas a esta patología. Se obtuvieron muestras de bilis de 28 individuos sanos y 16 pacientes con colelitiasis, de las que se extrajo el ADN biliar siguiendo un protocolo optimizado. A partir de las 44 muestras se llevó a cabo la secuenciación masiva de amplicones del ADNr 16S mediante la tecnología Illumina. Además, se realizó secuenciación masiva por shotgun y análisis de metagenómica funcional de tres muestras de bilis de sujetos sanos. Los resultados mostraron una gran diversidad microbiana presente en este tipo de muestras, con presencia de 4 filos mayoritarios: Firmicutes, Bacteriodetes, Actinobacteria y Proteobacteria. El análisis estadístico mostró diferencias significativas en la abundancia relativa de diversos taxones presentes en la bilis de ambos grupos. En concreto, secuencias de la familia Propionibacteriaceae fueron más abundantes en la bilis de los sujetos sanos, mientras que en pacientes con colelitiasis fueron más frecuentes las de las familias Bacteroidaceae, Prevotellaceae y Veillonellaceae. La secuenciación del ADN total biliar de tres sujetos sanos nos permitió realizar un análisis de sus metagenomas. El análisis funcional mostró que la asignación a las principales categorías funcionales del COG es similar a la del microbioma intestinal humano.Peer reviewe