IL4R, IL13, IL17A, and GSTP1 polymorphims and susceptibility to asthma and rhinitis

Dissertação de mestrado em Investigação Biomédica (Infeção e Imunidade), apresentada à Faculdade de Medicina da Universidade de CoimbraBACKGROUND: Asthma and rhinitis have a complex etiology, depending on multiple genetic and environmental risk factors. An increasing number of susceptibility genes are currently being identified, but the majority of reported associations have not been consistently replicated across populations of different genetic backgrounds. AIMS: To evaluate whether polymorphisms of IL4R (rs1805015), IL13 (rs20541), IL17A (rs2275913) and GSTP1 (rs1695) genes are associated with rhinitis and/or asthma in adults of Portuguese ancestry and to compare genetic profiles of these two related phenotypes. METHODS: 192 unrelated healthy individuals and 232 patients, 83 with rhinitis and 149 with asthma, were studied. All polymorphisms were detected by real-time polymerase chain reaction (PCR) using TaqMan assays. RESULTS: Compared to controls, a significant association with asthma was observed for GSTP1 rs1695 AA genotype (Odds Ratio (OR) – 1.96; 95% CI - 1.18 to 3.25; p= 0.010). The association sustains for allergic asthma (OR – 2.17; 95% CI - 1.23 to 3.80; p= 0.007). IL13 rs20541 GG genotype was associated with less susceptibility to asthma (OR – 0.55, 95% CI - 0.33 to 0.94, p= 0.028). Comparing both phenotypes, IL17A rs2275913 AA genotype was less associated with asthma than with rhinitis (OR – 0.20; 95% CI of 0.07 to 0.56; p= 0.002). A similar association was found for IL13 rs20541 GG genotype (OR – 0.48; 95% CI of 0.25 to 0.93; p= 0.031). There were no significant differences in the distribution of allelic and genotypic frequencies between patients and controls for the IL4R polymorphism’ analysed. Hardy-Weinberg equilibrium was verified for all SNPs. CONCLUSION: These results support the existence of a significant association between GSTP1 rs1695 and IL13 rs20541 SNPs, with susceptibility to asthma, in the population studied. Different genotype profiles of IL17A and IL13 genes seem to influence the clinical pattern of disease expression mainly confined to the upper airways, as rhinitis, or including the lower airways, as asthma.INTRODUÇÃO: A asma e a rinite têm uma etiologia complexa, dependendo de vários fatores de risco genéticos e ambientais. Um crescente número de genes de suscetibilidade tem sido identificado, mas os resultados não têm sido consistentemente reproduzidos em estudos de populações de diferentes origens genéticas. OBJETIVOS:. Avaliar se os polimorfismos IL4R (rs1805015), IL13 (rs20541), IL17A (rs2275913) e GSTP1 (rs1695) estão associados a suscetibilidade para rinite e/ou com a asma em indivíduos adultos de ascendência Portuguesa e comparar os perfis genotípicos dos dois fenótipos. MÉTODOS: Os polimorfismos foram estudados em 210 doentes, 83 com rinite e 149 com asma, e em 192 indivíduos controlo, não consanguíneos. A genotipagem foi realizada pela técnica de reação de polimerização em cadeia (PCR) em tempo real com sondas TaqMan. RESULTADOS: Comparativamente ao grupo controlo, foi observada uma associação significativa com a asma para o genótipo AA do GSTP1 rs1695 (Odds Ratio (OR) - 1,96; IC 95% - 1,18-3,25; p = 0,010). Esta associação mantém-se para a asma alérgica (OR - 2,17; IC de 95% - 1,23-3,80; p = 0,007). O genótipo GG do IL13 rs20541 foi associado a uma menor suscetibilidade para a asma (OR - 0,55, 95% CI - 0,33 a 0,94, p = 0,028). Comparando os dois grupos de doentes, o genótipo AA do IL17A rs2275913 está menos associado com asma do que com rinite (OR - 0,20; IC 95% de 0,07-0,56; p = 0,002). Um resultado semelhante foi encontrado para o genótipo GG de IL13 rs20541 (OR - 0,48; IC 95% entre 0,25 e 0,93; p = 0,031). Não foram encontradas diferenças significativas na distribuição das frequências alélicas e genotípicas, entre os grupos estudados, para o polimorfismo do IL4R analisado. O equilíbrio de Hardy Weinberg foi verificado para todos os SNPs. CONCLUSÃO: Estes resultados sugerem, para a população estudada, a existência de uma associação significativa entre os SNPs rs1695 do GSTP1 e rs20541 da IL13 e a suscetibilidade para a asma. Diferentes perfis dos genes IL17A e IL13 parecem influenciar a localização preferencial das manifestações da doença, com predomínio nas vias respiratórias superiores, como na rinite, ou nas vias aéreas inferiores, no caso da asm