Isolation and characterization of plant growth promoting bacteria isolated from garlic (allium sativum).

Garlic has great economic and social importance in Santa Catarina. It is a demanding crop in nutrients, being necessary high amount of chemical fertilizers, increasing the cost of production and the environmental impact. An alternative to the use of inputs are Rizobacteria Promoting Plant Growth (RPCP). Among the RPCPs, the most studied genera are Azospirillum, Bacillus and Pseudomonas of the fluorescent group that have shown benefits for the growth of several plant species. In this context, isolates of RPCP obtained from the rhizosphere of garlic maintained in protected cultivation were phenotypically and genotypically characterized and a growth promotion test in vivo was carried out, in protected cultivation. The biochemical tests used for phenotypic characterization were glucose and sucrose fermentation, Methyl Red (MR), catalase production and urea hydrolysis. The potential of plant growth induction was also evaluated by analyzing the production capacity of IAA (Indol-Acetic Acid) and calcium phosphate solubilization in vitro. Twenty-seven isolates were obtained. For the biochemical tests, 21 isolates were able to ferment glucose and 26, sucrose. For the other tests, all isolates showed a positive reaction. As for the mechanisms of plant growth promotion, 81.5% and 66.6% of the isolates presented IAA production and phosphate solubilizing capacity, respectively. The in vivo growth promotion test using maize (Zea mays) as a model indicated that the tested isolates (EB02, EB16, EB14, EB26, EB23) showed similarity to the treatment with 100% recommended nitrogen fertilization. The isolates were identified by sequencing the 16S rRNA gene. Fourteen isolates (51, 85% of the collection) were identified as Bacillus subtillis, including those tested in planta. These microorganisms present potential for the promotion of plant growth.O alho possui grande importância econômica e social em Santa Catarina. É um cultivo exigente em nutrientes, sendo necessária elevada quantidade de fertilizantes químicos, incrementando o custo de produção e o impacto ambiental. Uma alternativa ao uso de insumos são as Rizobactérias Promotoras de Crescimento de Plantas (RPCP). Dentre as RPCPs, os gêneros mais estudados são Azospirillum, Bacillus e Pseudomonas do grupo fluorescente que têm demonstrado benefícios para o crescimento de várias espécies vegetais. Neste contexto, foram caracterizados, fenotípica e genotipicamente, isolados de RPCP obtidos da rizosfera de alho mantido em cultivo protegido e realizado teste de promoção de crescimento in vivo, também em cultivo protegido. Os testes bioquímicos utilizados para caracterização fenotípica foram fermentação de glicose e sacarose, Vermelho de Metila (VM), produção de catalase e hidrólise da ureia. Também foi avaliado o potencial de indução do crescimento vegetal, mediante análise da capacidade de produção de AIA (Ácido Indol-Acético) e de solubilização de fosfatos de cálcio in vitro. Foram obtidos 27 isolados. Para os testes bioquímicos, 21 isolados foram capazes de fermentar a glicose e 26, a sacarose. Para os demais testes, todos isolados apresentaram reação positiva. Quanto aos mecanismos de promoção de crescimento vegetal, verificou-se que 81,5% e 66,6% dos isolados apresentaram produção de AIA e capacidade de solubilizar fosfato, respectivamente. O teste de promoção de crescimento in vivo, utilizando milho (Zea mays) como modelo, indicou que os isolados (EB02, EB06, EB14, EB16, EB26) testados apresentaram similaridade com o tratamento com 100% de adubação nitrogenada recomendada. Os isolados foram identificados por sequenciamento do gene 16S rRNA. Quatorze isolados (51, 85% da coleção) foram identificados como Bacillus subtillis, incluindo os testados in planta. Estes microrganismos apresentaram potencial para a promoção do crescimento da planta