Frequency and association of polymorphisms in CSN3 gene with milk yield and composition in Saanen goats

K-casein (CSN3) gene is of particular interest in goat production due to the effect of its polymorphisms on milk quality and composition. The objective of this study was to assess the genotypic and allelic frequencies in CSN3 gene in the Saanen goat breed and its effect on milk production and some of its compositional traits. Allelic discrimination assays were designed to determine the variants (A, B or C) using qPCR and allelic discrimination method. Allelic frequencies for A, B and C were 0.23, 0.64 and 0.13, respectively. Association analysis indicated that the CSN3 was significantly associated only with protein percentage (p = 0.006). Results indicated that animals with AC, BB and CC genotypes showed higher milk protein percentage than those with genotype AB. This evidence suggests that genotypes favorable to this associated trait could be included into Saanen goat breeding strategies.El gen de la к-caseína (CSN3) es de especial interés debido al efecto de sus polimorfismos sobre la calidad y composición de la leche. El objetivo de este estudio fue investigar las frecuencias genotípicas y alélicas del gen CSN3 en la raza caprina Saanen y su efecto sobre la producción de leche y algunas de sus características de composición. Se diseñaron diferentes ensayos de discriminación alélica para determinar las variantes (A, B y C) mediante qPCR. Las frecuencias alélicas para las variantes A, B y C fueron de 0.23, 0.64 y 0.13, respectivamente. El análisis de asociación indicó que el gen CSN3 esta asociado solamente al porcentaje de proteína en leche (p = 0.006). Los resultados mostraron que los animales con los genotipos AC, BB y CC producen leche con mayor porcentaje de proteína que aquellos con el genotipo AB. Esta evidencia sugiere que los genotipos favorables para la característica asociada podrían incluirse en estrategias de selección asistida por marcadores en cabras de la raza Saanen