Diagnóstico molecular diferencial de Colletotrichum gloeosporioides y Fusarium oxysporum en ñame (Dioscorea sp.)

Fungal diseases are responsible for the greatest losses in the Colombian yam crop, among these the anthracnose stands out as the most devastating. In recent years, fungi with low prevalence but high spread power such as F. oxysporum have expanded its presence in yam crops favoring the development of rot disease. Despite the importance of yam crop on the Colombian Caribbean Coast, the Pacific and the Amazon, this is considered an orphan crop because are few efforts made in its investigation in the world and particularly in Colombia. In order to contribute to the correct and timely diagnosis of fitopathogens that affect the yam crop, this study obtained fungal isolates from leaves with necrotic spots. Of these isolates, five showed morphological characteristics of Colletotrichum and three of Fusarium genus. The species identity was determined by ITS secuencing, corresponding to Colletotrichum gloeosporioides and Fusarium oxysporum. The evaluation of molecular markers for differential and simultaneous detection of these pathogens allowed to choose the elongation factor alpha (EF-α) as the best diagnostic test. Pathogenicity test confirmed the capacity of C. gloeosporioides to cause anthracnose symptomatology in leaves and F. oxysporum isolates to trigger rot in tuber, whose presence huésin leaves could been associated to its easy and fast conidial spread, to its heightened incidence in soil which is its natural habitat, and its prolonged survival.Las enfermedades de origen fungico son responsables de las mayores perdidas reportadas en los cultivos de name colombianos, entre ellas la antracnosis causada por Colletotrichum spp. se destaca por ser la mas devastadora. En los ultimos anos, hongos con baja prevalencia pero con alto poder de diseminacion como Fusarium spp., han ampliado su presencia en los cultivos de name favoreciendo el desarrollo de enfermedades como la pudricion del tuberculo en postcosecha. A pesar de la importancia del cultivo de name en las regiones de la Costa Atlantica colombiana, el Pacifico y la Amazonia, este es considerado un cultivo huerfano en razon a que son pocos los esfuerzos que en investigacion se realizan a nivel mundial y particularmente en Colombia. Con el proposito de aportar al diagnostico correcto y oportuno de fitopatogenos que afectan el cultivo de name, se obtuvieron aislamientos fungicos a partir de hojas con manchas necroticas. De los aislamientos obtenidos, cinco presentaron morfologia propia del genero Colletotrichum y tres de Fusarium. La identidad de las especies implicadas se determino por secuenciacion de los ITS del ADNr, correspondiendo a Colletotrichum gloeosporioides y Fusarium oxysporum. La evaluacion de marcadores moleculares para la deteccion de forma diferencial y simultanea de estos patogenos, permitio seleccionar la amplificacion del factor de elongacion alpha (EF-α) como la mejor prueba de diagnosis. Las pruebas de patogenicidad confirmaron la capacidad de los aislados de C. gloeosporioides para causar sintomatologia de antracnosis en foliolos y de los aislados de F. oxysporum para desencadenar pudricion en tuberculo, la presencia de este ultimo en hojas se podria asociar a su facil y rapida dispersion conidial, a su acentuada incidencia en suelo que es su habitat natural y a su prolongada sobrevivencia