Significance, occurrence and determinants of horizontally transmissible colistin resistance in Gram negative bacteria

Kolistín, označovaný aj ako polymyxín E, je účinným antibiotikom proti väčšine gramnegatívnym baktériam a v súčasnej dobe sa používa ako liek poslednej voľby na terapiu infekcií spôsobených multirezistentnými baktériami. Objavenie plazmidom sprostredkovanej rezistencie proti kolistínu kódovanej génom mcr-1 v roku 2015 v Číne predstavuje veľkú hrozbu. Postupom času boli opísané ďalšie mcr gény: mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7 a mcr-8, ktoré sú rozšírene už po celom svete. Cieľom tejto diplomovej práce bolo objasniť výskyt horizontálne prenosnej rezistencie proti kolistínu kódovanej génmi mcr pri gramnegatívnych baktériách izolovaných zo životného prostredia, zvierat a prostredia ich chovu a potravín. Gén mcr-1 bol detegovaný v 2 izolátoch Escherichia coli zo vzoriek odpadovej vody. Gén mcr-4 bol detegovaný v 1 izoláte Shewanella putrefaciens z vody rybníka. Najvýznamnejším zdrojom a cestou šírenia tohto typu rezistencie v Českej republike je životné prostredie.Colistin, also known as polymyxin E, is antibiotics active against most of Gram-negative bacteria. In the pas decade, emergency of multidrug-resistant bacteria led to increase of colistin administration as a last resort antibiotic for human infections. The first plasmid-mediated colistin resistance gene mcr-1 was identified in 2015 in animals in China and after first detection, additional mcr genes: mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7 a mcr-8 were described throughout the world. The aim of this thesis was to clarify whether there is horizontal transmission colistin resistance encoded by the mcr genes in gram-negative bacteria isolated from the environment, animals and their breeding and food. The mcr-1 gene was detected in 2 strains Escherichia coli isolated from waste water. The mcr-4 gene was detected in 1 strain Shewanella putrefaciens isolate obtained from the lake. The environment is the most important source and way of spreading this type of resistance in the Czech Republic.