Caracterização de variantes de Grapevine Fanleaf Virus (GFLV), Arabis Mosaic Virus (ARMV) e respectivos RNAS satélites presentes em castas portuguesas de Vitis Vinifera

Dissertação de mestrado, Biologia Molecular e Microbiana, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015Grapevine fanleaf virus, vírus do urticado ou nó-curto da videira e Arabis mosaic virus são dois Nepovirus, da família Secoviridae e ambos possuem um genoma bipartido de cadeia simples e sentido positivo. Além destes, foram detetados em alguns isolados de ArMV e GFLV, RNAs satélite de grande tamanho, satRNA do tipo B. Estes vírus encontram-se entre os principais agentes causadores do complexo de degenerescência da videira, uma das doenças virais mais devastadoras e dispersas pelo mundo, e estão incluídos no esquema de certificação da videira em vigor na União Europeia (Diretiva 68/193/CEE e Diretiva 2002/11/CE). Neste trabalho, a presença de Arabis mosaic virus foi confirmada, através de métodos moleculares, em Portugal. Determinaram-se as relações filogenéticas das variantes de GFLV da “homing protein”, das proteínas do movimento, da cápside e da RNA polimerase RNA-dependente, de modo a caracterizar a diversidade genética de isolados de GFLV em Portugal. Determinou-se, também, a incidência e variabilidade de satRNA em isolados de GFLV. O conhecimento da variabilidade genética permitirá melhorar as ferramentas de diagnóstico molecular e serológico, de modo a implementar um protocolo de deteção robusto adequado ao esquema de certificação em vigor no país