RedIBio - Uma ferramenta para visualização de Redes de Interações Biológicas

Orientador : Prof. Dr. Alessandro BrawermanCoorientadora : Profa. Dra. Maria Berenice R. SteffensDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Educação Profissional e Tecnológica, Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. Defesa: Curitiba, 15/12/2016Inclui referências : f. 70-73Resumo: A representação gráfica de dados biológicos é considerada uma problemática crescente no âmbito da pesquisa, pois a quantidade de informações a se interpretar aumenta em um ritmo acelerado. Neste cenário, o desenvolvimento de ferramentas que auxiliem na interpretação de grande quantidade de dados é uma necessidade. A visualização da informação oferece recursos para análise de dados e geração de conhecimentos. Um dos métodos para representação de dados na forma gráfica é a rede, que possibilita a visualização do todo e a detecção de padrões de interação. A entrega do formato visual, no tipo rede, simplificado para a compreensão de informações biológicas complexas e aliado à conexão com uma fonte externa de informação, é o objetivo proposto pelo projeto. A ferramenta desenvolvida e denominada RedIBio - Redes de Interação Biológicas, oferece também o recurso de interação que possibilita a navegabilidade através dos objetos que compõem a estrutura da rede. A rede gerada pela ferramenta é visualizada em três dimensões garantindo que os componentes da rede sejam representados sem sobreposição em uma área maior. Sua disponibilidade e funcionamento ocorre totalmente pela Internet, dispensando, assim, a necessidade de instalação local e preocupações com compatibilidade e atualizações recorrentes. Como resultado final, a RedIBio não se limita apenas em apresentar os dados contidos no arquivo de entrada, pois sua integração com banco de dados biológico permite o acesso a informações detalhadas a respeito do objeto que são úteis ao usuário. Palavras-chave: Visualização da informação. Rede biológica. Ferramenta biológica.Abstract: The graphical representation of biological data is considered a growing problem in research, because the amount of information to be interpreted increases at an accelerated pace. In this scenario, the development of tools that aid in the interpretation of large amounts of data is a necessity. Visualization of information provides resources for data analysis and knowledge generation. One of the methods for representing data in graphic form is the network, which enables the visualization of the whole and the detection of patterns of interaction. The delivery of the visual format, in the network type, simplified for the understanding of complex biological information and allied to the connection with an external source of information, is the objective on this project. The tool developed and called RedIBio - Redes de Interação Biológicas, also offers the interaction feature that enables navigability through the objects that make up the network structure. The network generated by the tool is visualized in three dimensions ensuring that the network components are represented without overlapping over a larger area. Its availability and operation occurs entirely over the Internet, thus dispensing with the need for local installation and concerns with compatibility and recurring updates. As a final result, RedIBio is not only limited to presenting the data contained in the input file, since its integration with a biological database allows access to detailed information about the object that is useful to the user. Key-words: Visualization of information. Biological network. Biological tool