ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO

ISOLASI DNA DENGAN METODE DOYLE AND DOYLE DAN ANALISIS RAPD PADA SAWO. Skripsi : Agus Santika Sitepu (H0713012). Pembimbing: Endang Yuniastuti, Parjanto. Program Studi : Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Sebelas Maret Surakarta Sawo merupakan salah satu tanaman hortikultura yang sangat berpotensial untuk dikembangkan. Akan tetapi penelitian mengenai sawo terutama di bidang molekuler masih sedikit dilakukan. Oleh karena itu perlu dilakukan penelitian mengenai sawo agar dapat dimanfaatkan untuk pemuliaan tanaman. Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Januari sampai april 2017 di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan Tanaman, Universitas Gajah Mada Yogyakarta. Penelitian ini dilaksanakan dengan mengamati pita DN menggunakan mesin PCR dengan metode RAPD. Sampel terdiri dari dua aksesi yaitu aksesi Manyaran dan aksesi Bojonegoro. Isolasi DNA yang dilakukan menggunakan metode Doyle and Doyle. Hasil isolasi DNA sawo kemudian dianalisis dengan metode RAPD melalui seleksi primer. Primer yang digunakan yaitu OPA 11, OPA 12, OPA 13, OPA 14, OPA 15, OPA 16, OPA 17, OPA 18, OPA 19, dan OPA 20. Hasil amplifikasi DNA sawo diamati dengan elektroforesis. Dari seleksi primer yang dilakukan, ditemukan 6 primer yang menunjukkan pita DNA yaitu OPA 11, OPA 13, OPA 16, OPA 18, OPA 19, dan OPA 20. Jumlah total pita DNA yang dihasilkan yaitu 38 pita yang memiliki kisaran pita 200-900 bp. Presentasi pita polimorfik yang paling tinggi yaitu 50% diperoleh dari amplifikasi primer OPA 11 dan OPA 19, sedangkan presentasi pita polimorfik yang paling rendah yaitu 33,33% diperoleh dari amplifikasi opa 20. Kemiripan genetik sawo Manyaran dan sawobojonegoro berdasarkan perhitungan data skoring menggunakan program NTSys 2.02i menunjukkan angka sebesar 0,79