Analisis Molecular Docking Reseptor Estrogen α terhadap Fitokimia Famili Asteraceae Dibandingkan Tamoksifen pada Kanker Payudara

Dzulfiar Nasir Umam, G0011079, 2014. Analisis Molecular Docking Reseptor Estrogen α terhadap Fitokimia Famili Asteraceae Dibandingkan Tamoksifen pada Kanker Payudara. Skripsi. Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret Surakarta. Latar Belakang: Tamoksifen merupakan terapi hormonal utama kanker payudara yang mengekspresikan reseptor estrogen α (ERα). Beberapa fitokimia mempunyai aktivitas sebagai antikanker. Akan tetapi, data tentang aktifitas fitokimia famili Asteraceae di Indonesia masih sedikit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui afinitas ikatan dan lokasi ikatan dari fitokimia famili Asteraceae di Indonesia dibandingkan tamoksifen terhadap ERα pada kanker payudara. Metode: Jenis penelitian ini merupakan penelitian bioinformatika. Subjek penelitian adalah struktur 3 dimensi ERα, tamoksifen, dan 186 fitokimia tumbuhan famili Asteraceae yang didapatkan dari database HerbalDB, Pubchem Compound, dan Protein Data Bank. Subjek dipreparasi menggunakan Chimera 1.10 dan Open Babel. Tamoksifen di-docking pada ERα menggunakan AutoDock Vina untuk mengetahui afinitas ikatan kompleks ligan-reseptor, kemudian dibandingkan dengan ligan dari fitokimia. Visualisasi lokasi ikatan ligan-reseptor menggunakan Pymol 1.7.2. Hasil: Hasil docking menunjukkan empat fitokimia mempunyai afinitas ikatan yang lebih kuat dari tamoksifen (-9,6 kkal/mol) yaitu lappadilactone, friedelin, benperidol, dan beta-amyrin. Hasil visualisasi menunjukkan lappadilactone, friedelin, benperidol, beta-amyrin, taraxerol, dan epifriedelanol mempunyai daerah pengikatan yang mirip dengan tamoksifen terhadap ERα. Lappadilactone mempunyai ikatan hidrogen dengan Tyr526 dan benperidol mempunyai ikatan hidrogen dengan Trp383 pada ERα. Simpulan: Lappadilactone dan benperidol mempunyai afinitas ikatan yang lebih kuat dari tamoksifen dan mempunyai ikatan hidrogen terhadap ERα tetapi bukan di active site-nya. Oleh karena itu, lappadilactone dan benperidol kemungkinan mempunyai kemampuan dalam menghambat aktivitas ERα secara komputasi