Identification and characterization of orthologs of human transporter ABCC10 in Catharanthus roseus and Arabidopsis thaliana

Les transporteurs ABC sont les membres d'une superfamille de protéines qui utilisent l'hydrolyse de l'ATP pour déplacer une large gamme de substrats au travers des membranes biologiques. Les membres de la sous famille ABCC sont généralement caractérisés par un domaine transmembranaire supplémentaire en région N-terminal (TMD0). Dans cette étude, nous avons analysé deux gènes ABCC de plantes : CrABCC1 de Catharanthus roseus et AtABCC13 son orthologue chez Arabidopsis thaliana. L'analyse phylogénétique répartit les ABCC de plantes dans 3 clades distinctes. Les clades I et II sont spécifiques aux plantes tandis que le clade III est le seul associant des ABCC humains et de plantes. Le criblage de la base de données a permis d'identifier 16 séquences ABCC chez Catharanthus roseus parmi lesquelles 2 appartiennent à CrABCC.ABC transporters are members of a large superfamily of proteins that utilize ATP hydrolysis to translocate a wide range of substrate across biological membranes. Members of C. subfamily (ABCC) are generally structurally characterized by an additional (N-Terminal) transmembrane domain (TMD0). In this study the analysed two plant ABCC : CrABCC1 from Catharanthus roseus and AtABCC13, it's ortholog in Arabidopsis thaliana. Phylogenetic analysis of plant ABCCs separates their protein sequences over three distinct clusters : I and II are plant specific whereas cluster III is the only gathering humain and plant ABCCs. Screening of plant database allowed us to identify 16 different ABCCs sequences in Catharanthus roseus