Segmentation d'images intégrant la morphologie mathématique et les contours actifs : application à l'extraction d'éléments ou d'ensembles cellulaires en imagerie microscopique médicale

International audienceLa segmentation d'images microscopiques médicales, pour extraire les objets correspondant aux structures biologiques pertinentes, est un problème complexe en raison de la diversité des caractéristiques des objets et des objectifs de l'analyse. De plus, la segmentation est une étape indispensable, en particulier dans le domaine de la cancérologie, pour la quantification de l'ADN nucléaire d'une population cellulaire, à partir d'image en niveaux de gris de noyaux isolés, pour le calcul de l'immunomarquage sur coupes histologiques, pour la caractérisation de l'architecture tumorale, etc. Cette variété de classes d'images et de problèmes posés implique l'utilisation de techniques et de stratégies de traitement d'images très différentes. Nous proposons une méthode générale impliquant deux types d'outils : la morphologie mathématique et les contours actifs. Les outils morphologiques permettent une simplification adaptée et une extraction de marqueurs. Cette étape constitue l'initialisation des contours actifs. La localisation est effectuée par croissance de régions ou par algorithme de ligne de partage des eaux implémentée par l'équation eikonale, ou par l'approche géométrique des contours actifs