Trouver un arbre de gène dans le réseau des espèces : le labyrinthe du vivant !

National audienceVous pensez que l'évolution des espèces peut se représenter par un arbre ? La transmission de matériel génétique entre espèces co-existantes est pourtant très fréquente dans le monde du vivant. Transfert de gènes entre deux espèces de bactéries, apparition d'une espèce hybride, recombinaison entre deux souches de virus, divers phénomènes biologiques conduisent des branches de l'arbre à se rejoindre : on obtient alors un réseau des espèces. Mais si l'on considère un gène en particulier, son histoire reste le plus souvent représentée sous forme d'un arbre. Comment trouver l'arbre d'un gène à l'intérieur du réseau des espèces ? Il s'agit d'un problème informatique difficile, mais pour lequel plusieurs méthodes de résolution ont été trouvées quand le réseau a des propriétés particulières. Cet atelier vise à faire manipuler certains exemples du problème pour prendre conscience de sa difficulté : arriverez-vous à retrouver l'arbre dans le labyrinthe du vivant