The use of oligonucleotide probes for meningococcal serotype characterization

In the present study we examine the potential use of oligonucleotide probes to characterize Neisseria meningitidis serotypes without the use of monoclonal antibodies (MAbs). Antigenic diversity on PorB protein forms the bases of serotyping method. However, the current panel of MAbs underestimated, by at least 50% the PorB variability, presumably because reagents for several PorB variable regions (VRs) are lacking, or because a number of VR variants are not recognized by serotype-defining MAbs12. We analyzed the use of oligonucleotide probes to characterize serotype 10 and serotype 19 of N. meningitidis. The porB gene sequence for the prototype strain of serotype 10 was determined, aligned with 7 other porB sequences from different serotypes, and analysis of individual VRs were performed. The results of DNA probes 21U (VR1-A) and 615U (VR3-B) used against 72 N. meningitidis strains confirm that VR1 type A and VR3 type B encode epitopes for serotype-defined MAbs 19 and 10, respectively. The use of probes for characterizing serotypes possible can type 100% of the PorB VR diversity. It is a simple and rapid method specially useful for analysis of large number of samples.No presente trabalho nós examinamos o uso potencial de sondas de oligonucleotídeos para caracterizar sorotipos de Neisseria meningitidis sem o uso de anticorpos mono-clonais (MAbs). A diversidade antigênica da proteína PorB forma a base do método de sorotipagem, todavia, o atual painel de MAbs utilizados, sub-estima em no mínimo 50% a diversidade desta proteína devido a falta de reagentes para as várias regiões variáveis (VRs) da proteína PorB ou porque várias variantes das VRs não são reagentes com os MAbs disponíveis. Nós analisamos o uso de sondas de oligonucleotídeos para caracterizar os sorotipos 10 e 19 de N. meningitidis. O gene porB da cepa protótipo do sorotipo 10 foi sequenciado e alinhado com outras 7 sequências de diferentes sorotipos, e as individuais VRs foram então analisadas. Os resultados com as sondas 21U (VR1-A) e 615U (VR3-B) contra 72 cepas de N. meningitidis confirmaram que VR1-A e VR3-B codificam epítopos para os MAbs 19 e 10 respectivamente. É possível o uso de sondas para a caracterização dos sorotipos e podemos tipar 100% da diversidade da VR do gene porB. Trata-se de um método simples, rápido, e especialmente útil para a análise de um grande número de amostras