Prevalence of extended-spectrum β-lactamases-producing bacteria at Split University Hospital and their impact in the choice of antibiotic therapy

Cilj istraživanja: Odrediti učestalost sojeva E. coli i K. pneumoniae koji luče β-laktamaze proširenog spektra u KBC-u Split, stupanj rezistencije na gentamicin, kotrimoksazol, ciprofloksacin i karbapeneme. Ustroj istraživanja: Retrospektivno su iz pismohrane Kliničkog zavoda za mikrobiologiju i parazitologiju izdvojeni podaci o uzorcima iz kojih su izolirani sojevi E. coli i K. pneumoniae koji stvaraju β-laktamaze proširenog spektra, te rezultati ispitivanje njihove osjetljivosti na antibiotike za dvogodišnje razdoblje od 1. siječnja 2009. do 31. prosinca 2010. godine. Mjesto istraživanja: Klinički zavod za medicinsku mikrobiologiju i parazitologiju KBC-a Split, Spinčićeva 1, Split. Sudionici: U istraživanje su uključene svi sojevi E. coli i K. pneumoniae izolirani u laboratoriju Kliničkog zavoda za mikrobiologiju i parazitologiju u vremenu od 1. siječnja 2009. zaključno s 31. prosinca 2010. prikupljene iz različitih izvora (dišni sustav, mokraćni sustav, koža i meka tkiva, krv, ostalo), od pacijenata različite dobi (odrasli/pedijatrija) i s različitih bolničkih odjela (JIL/ostali). Zatim su izolirani sojevi podijeljeni u dvije skupine s obzirom na to da li proizvode β-laktamaze proširenog spektra ili ne (ESBL vs. nonESBL) te je ispitana njihova osjetljivost na gentamicin, kotrimoskazol, ciprofloksacin i karbapeneme (ertapenem, imipenem, meropenem). Iz istraživanja su isključene ponovljeni izolati porasli iz uzorka istog pacijenta. Glavne mjere ishoda: Učestalost izolata E. coli i K. pneumoniae koji stvaraju β-laktamaze proširenog spektra, te rezultati ispitivanja njihove osjetljivosti na antibiotike. Rezultati: U KBC-u Split 17% izoliranih E. coli i K. pneumoniae proizvodi β-laktamaze proširenog spektra. Od toga 6,0% od ukupno izoliranih E. coli i 41,4% ukupno izoliranih K. pneumoniae. Izvor s kojeg su ESBL(+) izolati najčešće prikupljeni za E. coli je dišni sustav (10,5%), a za K. pneumoniae mokraćni sustav (47,3%). Odjel s kojeg su značajno češće ESBL(+) izolati prikupljeni su Jedinice intenzivnog liječenja (JIL). Učestalost ESBL(+) sojeva je bila viša na odjelima odrasle populacije nego kod pedijatrijskih pacijenata. Među sojevima koji proizvode β-laktamaze proširenog spektra izolati E. coli su se pokazali značajno rezistentnijim na kotrimoksazol (63,2%; 48,2%; P=0,0007), a izolati K. pneumoniae na gentamicin (59%; 39%; P<0,0001) i ciprofloksacin (54%; 40,5%; P=0,0026). Nije zabilježena značajna rezistencija na karbapeneme. Zaključci: Našim istraživanjem utvrdili smo da je učestalost sojeva E. coli i K. pneumoniae koji proizvode β-laktamaze proširenog spektra u KBC-u Split 17%. Karbapenemi su i dalje antibiotik izbora za ozbiljne infekcije uzrokovane ovim sojevima bakterija.Objective: To determine prevalence of E. coli and K. pneumoniae strains that produce extended-spectrum β-lactamases at Split University Hospital and their susceptibility to gentamicin, cotrimoxazole, ciprofloxacin and carbapenems. Design: For the 2-year period from January 1, 2009 to December 31, 2010 data concerning isolates of E. coli and K. pneumoniae that produce extended-spectrum β-lactamases and their antimicrobial susceptibility was obtained retrospectivly from the archives of the Department of Clinical Microbiology and Parasitology. Settings: Department of Clinical Microbiology and Parasitology, University Hospital Split Participants: The study included all strains of E. coli and K. pneumoniae isolated in the laboratory of the Department of Clinical Microbiology and Parasitology from January 1, 2009 to December 31, 2010 at Split University Hospital from different clinical sources (urinary tract, respiratory tract, skin and soft tissue, blood, other), different hospital wards (ICU/other wards) and different age groups (adult/pediatric patients). Isolates were than divided into two groups based on their ability to produce extended-spectrum β-lactamases or not (ESBL vs. nonESBL) and their antimicrobial susceptibility to gentamicin, cotrimoxazol, ciprofloxacin and carbapenems was tested. Only one isolate per patient was included in the study. Main Outcome Measures: Prevalence of extended-spectrum β-lactamases-producing isolates and results of their antimicrobial susceptibility testing. Results: At Split University Hospital 17% of isolated E. coli and K. pneumoniae produce extended-spectrum β-lactamases. Of all of E. coli isolated 6,0% were ESBL-positive strains while for K. pneumoniae 41,4% isolates were ESBL producers. Most abundant source of ESBL-producing E. coli strains was the respiratory tract (10,5%) and for K. pneumoniae urinary tract (47,3%). The ward with significantly higher prevalence of ESBL-positive isolates was the ICU. The prevalence was higher in isolates obtained from adult patients than that in pediatric ones. Among ESBL-producers E. coli isolates were significantly more resistant to cotrimoxazole (63,2%; 48,2%; P=0,0007) and K. pneumoniae isolates to gentamicin (59%; 39%; P