Endotrofna mikoriza je simbioza između gljive i biljke, a pri čemu gljiva raste djelomično i unutar samog korijena biljke. U arbuskularnoj mikorizi (AM) gljive iz reda Glomeromycota tvore arbuskule unutar korijena biljke. To su razgranate hife nalik na drvo čija je zadaća prijenos hranjivih tvari između biljke i gljive. Prvenstveno je poboljšan prijenos fosfata i dušika u biljku, a ugljik nastao fotosintezom odlazi u gljivu. Tijekom evolucije, „genetički program“ AM poslužio je kao temelj i za druge simbioze koje uključuju korijen biljke pa tako dušik fiksirajuće bakterije koriste isti signalni put kao i AM. Međutim, molekularni mehanizmi koji vode do AM manje su poznati od onih koji dovode do simbioze biljke i dušik fiksirajuće bakterije p...