STATs, SOCS s as markers of kidney allograft dysfunction - analysis of gene expression and single nucleoti de polymorphisms

Wydział BiologiiMimo znacznego rozwoju transplantologii, patofizjologia chronicznej nefropatii nerek nadal pozostaje słabo zrozumiana i jest najważniejszym czynnikiem limitującym długoterminowe przeżycie allograftu nerki. Wydaje się być spowodowana przez szereg wieloczynnikowych procesów mediowanych m.in. przez czynniki regulujące procesy zapalne np.: cytokiny. Polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNPs) występujące w regionach genów kodujących cytokiny mogą wpływać na ich ekspresję i w niektórych przypadkach są zasocjowane z przeżywalnością allograftu. Istotnymi regulatorami zapalenia mediowanego przez cytokiny są białka STAT i SOCS- elementy szlaku sygnalizacyjnego JAK/STAT mogące uczestniczyć w procesie odrzucania allograftu. Celem pracy było zweryfikowanie, czy geny STAT, SOCS i inne geny kandydujące JAK/STAT zależne i niezależne, mogą posłużyć jako miara przeżywalności przeszczepu. Wykazano, że: a) geny STAT i SOCS ulegają różnorodnej ekspresji w monocytach i w limfocytach b) występuje zróżnicowana regulacja ekspresji genów STAT i SOCS w PBMCs i monocytach pomiędzy pacjentami z ESRD i populacją kontrolną, jak również w kolejnych okresach czasowych po przeszczepie nerki c) analiza haplotypów wyłoniła siedemnaście potencjalnie istotn ych SNPs. Otrzymane wyniki są na pograniczu istotności statystycznej sugerują c, iż istnieją również inne ścieżki sygnałowe, które są zasocjowane z ESRD i przeżywalnością przeszczepu nerki .Despite th e significant development s in transplantology, chronic pathophysiology of kidney nephropathy remains unclear. It seems to be caused by a series of multifactorial processes mediated, among others by factors regulating inflammatory processes, e.g. cytokines. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) that occur in genes that code for cytokines can affect their expression and, in some cases, are associated with the survival of the allograft. Significant regulators of inflammation, mediated by cytokines are the STA T and SOCS proteins - elements of the JAK / STAT signaling pathway that may participate in the rejection of the allograft. The aim of the study was to verify whether STAT, SOCS and other JAK / STAT dependent and independent candidate genes can be used as a measure of graft survival. The study revealed: a) Differential expression of STAT and SOCS genes in monocytes and lymphocytes b) Differential expression of STATs and SOCSs in PBMCs and monocytes between ESRD patients and control population, as well as in subseq uent follow up visits post transplantation c) Haplotype analysis identified seventeen potentially significant SNPs Obtained results are on the borderline of statistical significance and suggest that there are also other signaling pathways associated with ESRD and kidney graft survival.Praca współfinansowana z projektu KBN nr: N N302 3312 33 (2007-2011) pt.: "Połączona analiza ekspresji i haplotypu w genach STAT i SOCS jako wskaźnik przeżywalności allograftu nerki.