Selección de los marcadores cultivables y moleculares útiles para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el Río Bogotá

La detección de microorganismos patógenos intestinales en el agua se dificulta debido al alto costo de las pruebas y al tiempo de análisis. Como alternativa, se utilizan microorganismos indicadores, los cuales no diferencian si la contaminación es de origen fecal humano o animal, ya que hacen parte del tracto digestivo de ambos. Para discriminar el origen de la contaminación fecal, se ha propuesto el uso de marcadores dependientes de cultivo y moleculares que pueden presentar especificidad geográfica, por lo que es necesario identificar aquellos aplicables en nuestro medio. El objetivo de este trabajo fue seleccionar los marcadores cultivables y moleculares para diferenciar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá. Para diferenciar la contaminación de origen porcino, se aisló una cepa a partir de contenido intestinal de porcino identificada como Bacteroides fragilis PZ8. Se evaluaron indicadores no discriminantes: coliformes totales, E. coli, colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa de Bacteroides fragilis RYC2056, indicadores discriminantes: fagos que infectan las cepas de Bacteroides thetaiotaomicron GA17 y Bacteroides fragilis PZ8 y marcadores moleculares discriminantes: Bacteroidetes HF183F y CF128F, Bifidobacterium adolescentis (ADO) y Bifidobacterium dentium (DEN), mediante PCR, en agua residual proveniente de plantas de beneficio de ganado bovino y porcino, de Plantas de Tratamiento de Agua Residual Doméstica (PTARD) y del río Bogotá. Se evidenció que las cepas de Bacteroides GA17 y PZ8 tienen potencial para discriminar la contaminación fecal humana y de porcino respectivamente, en las aguas evaluadas. Con la relación entre colifagos somáticos y fagos que infectan la cepa GA17, de dos unidades, se evidenció que la contaminación del río Bogotá es principalmente de origen humano. Los marcadores moleculares HF183F, ADO y DEN indicaron la presencia de contaminación humana y el marcador CF128F, la presencia de contaminación bovina en las aguas evaluadas. Los resultados obtenidos permiten concluir que los marcadores seleccionados son potencialmente útiles para discriminar el origen de la contaminación fecal en el río Bogotá.The detection of intestinal pathogenic microorganisms in water is difficult due to the high cost of testing and the time of analysis. As an alternative, indicator microorganisms are used, which do not differentiate if the contamination is of human or animal fecal origin. To discriminate the origin of fecal contamination, it has been proposed the use of culture-dependent and molecular markers that may present geographic specificity, so it is necessary to identify those applicable in our environment. The objective of this work was to select the cultivable and molecular markers to differentiate the origin of the fecal contamination in the Bogotá river. For this a strain was isolated from porcine intestinal contents identified as Bacteroides fragilis PZ8. Non-discriminatory indicators as: total coliforms, E. coli, somatic coliphages and Bacteroides fragilis phages strain RYC2056, discriminant indicators: Bacteroides thetaiotaomicron strain GA17 and Bacteroides fragilis PZ8 phages, and molecular markers: HF183F, CF128F and Bifidobacterium adolescentis (ADO) and Bifidobacterium dentium (DEN), by PCR, in wastewater from bovine and porcine abattoir, wastewater treatment plants (WWTP) and Bogotá river. It was evidenced that strains GA17 and PZ8 have the potential to discriminate human and porcine fecal contamination, respectively, in the evaluated waters. The relationship between somatic coliphages and phage strain GA17 of two units, showed that the contamination of the Bogotá river is mainly of human origin. The molecular markers HF183F, ADO and DEN indicated the presence of human contamination and the marker CF128F, the presence of bovine contamination in the evaluated waters. The selected markers are potentially useful to discriminate the origin of fecal contamination in the Bogotá river