Anotación del transcriptoma foliar de la uchuva (Physalis peruviana L.): fruta promisoria de la familia solanaceae

La uchuva (Physalis peruvianaL.) es una Solanácea, consideradacomo frutal promisorio a nivel económico, nutricional y nutraceútico. Sin embargo, este cultivo presenta grandes limitantes de soporte tecnológico asociado a la poca información genómica de esta especie, como base para investigaciones relacionadas con problemas del cultivo.Este estudioreporta la secuenciación por 454 y anotaciónde una librería de ADNc normalizadagenerada a partir de tejidofoliar de un genotipo comercial de uchuva. Se obtuvo un total de 244Mpb a partir de 652.614 lecturas con un promedio de 375pb. El ensamblaje de novo, generó 24.014 isotigs y 110.921 singletons, con un promedio de 1.638pby 354pb, respectivamente. Con base en similaridad de secuencias con proteínas conocidas de lasbasesde datos Swissprot y RefSeq, se identificaron funciones putativas para 54.590 unigenes.Mediante Blast2GO, se asociaron 12.672 unigenes a términos ontológicos, relacionados con los principales procesos biológicos y funciones molecularesen plantas, además de familias de genes asociados a respuesta a estrés biótico y abiótico.Así mismo, a partir de los contigs ensamblados se identificaron 5.971 potenciales marcadores SSRs, dentro de los cuales se proponen 10posiblesmarcadoresrelacionados con la respuesta adefensa en plantas. Finalmente, los resultados obtenidos fueron depositados en una base de datospara su consulta.El primer catálogo de genes de uchuva será labase para la búsqueda de genes candidatos relacionados con característicasde interés que contribuyan a futuro al desarrollo de programas defitomejoramiento.Cape gooseberry (Physalis peruvianaL.) Is a Solanaceae, fruity consideradacomo promising in economic, nutritional and nutraceutical. However, this crop has great tech support constraints associated with little genomic information of this kind, as a basis for investigations into problems estudioreporta cultivo.Este by 454 sequencing and cDNA library anotaciónde normalizadagenerada tejidofoliar from a uchuva commercial genotype. There were a total of 652,614 244Mpb readings from an average of 375pb. The assembly novo generated isotigs 24,014 and 110,921 singletons, with an average of 354pb 1.638pby respectively. Based on sequence similarity with known proteins and RefSeq lasbasesde Swissprot data, we identified putative functions for Blast2GO unigenes.Mediante 54,590, 12,672 unigenes were associated to ontological terms, related to the main biological processes and functions molecularesen plants, plus families genes associated with response to biotic and abiótico.Así same, from the assembled contigs were identified potential 5,971 SSRs markers, within which the proposed 10posiblesmarcadoresrelacionados adefensa response in plants. Finally, the results obtained were deposited in a database consulta.El datospara its first catalog of genes Labase uchuva will search for candidate genes related to interest característicasde contribute to future program development defitomejoramiento