Spatial Epidemiology of Cancer: data types, spatial aggregation and geographical patterns in mainland Portugal

Tese de doutoramento em Information Management - Specialization in Geographical Information Systems, apresentada à NOVA Information Management School of Universidade Nova de Lisboa, 2018The importance of research on the spatial epidemiology of cancer has been progressively recognized and the number of studies in this field has been increasing steadily, having experienced significant growth over the last decade. Overall, spatial epidemiology is a comprehensive research area that covers a variety of subjects. Among those subjects, and particularly in the case of spatial epidemiology of cancer, one important topic is the level of spatial data aggregation. The analysis of individual data may present ethical data protection issues, so geographically-aggregated data are often used in epidemiological research. Conversely, the analysis of aggregated data also raises certain methodological issues, such as: a) the importance of calculating standardized rates (usually by sex and age) to allow for the comparison of different geographical units; b) the need to take into account the fact that the results obtained at a given level of geographical aggregation cannot be extrapolated as true for other levels of aggregation; and c) the possible existence of the “small numbers problem” and the relevance of using smoothed rates to try to solve it. This thesis takes a first look at this subject through a systematic review of the literature on the spatial epidemiology of cancer. The findings show that the questions which are considered most frequently in the literature consist of: a) the methodology used; b) the spatial distribution of cancer and its temporal evolution; and c) risk factors. The thesis then seeks to address these three aspects. In order to do that, several methodological issues related to the research of the spatial epidemiology of cancer are evaluated and the mortality distribution of all types of cancer is analyzed. Given the high rates of incidence and mortality due to colorectal cancer among the Portuguese population, this cancer type is taken as a case-study, and the distribution of its incidence and mortality is studied and compared with the distribution of the prevalence of the main risk factors. With regard to methodology, it is find that data aggregation at the municipality level makes it possible to obtain detailed information on the geographical distribution of cancer in mainland Portugal, and simultaneously address the small numbers problem. The use of statistical methods to calculate smoothed rates based on the spatial vicinity of the units under analysis also contributes to solving this latter problem. x Doctoral Programme in Information Management As far as cancer’s spatial distribution patterns are concerned, it is find significant heterogeneity across the municipalities of mainland Portugal, both when examining overall cancer mortality and when specifically looking at colorectal cancer incidence and mortality. Regarding the mortality distribution of all cancer types, it is find that the highest mortality rates tend to cluster around Oporto (on the north coast), Lisbon (on the west coast) and in the municipalities of southeast mainland Portugal. With respect to colorectal cancer, it are detected different patterns of incidence and mortality. The distribution of colorectal cancer incidence is more heterogeneous than that of colorectal cancer mortality. In addition, both colorectal cancer incidence and mortality exhibit especially high values for men in two municipalities in the center of mainland Portugal, which seems to call for a more detailed analysis of this area. In terms of risk factors, the following main risks, which have been identified as having a possible association with colorectal cancer, were considered: tobacco smoking; alcohol intake; and dietary behavior. Screening, as a secondary prevention measure aimed at the early detection of cancer and mortality reduction, was also considered in the analysis. However, data on these risk factors are representative only at much more aggregated geographic units, such as NUTS II. Therefore, a detailed analysis of association could not be performed. Finally, the natural background radiation in mainland Portugal was also analyzed, computing a mean by municipalities, and the conclusion is that its association with colorectal cancer is generally weak. This work points to a variety of interesting topics to study in future research, such as: a) to apply the same methodologies to other cancer types; b) to study the geographical association of risk factors, like socio-demographic and environmental risk factors, with cancer incidence and mortality; c) to test other spatial methods in the research of spatial epidemiology of cancer in Portugal, like, for an instance, kriging or multilevel models; and d) to establish suitable methodologies to study spatial epidemiology of cancer in the Portuguese islands.A importância da pesquisa sobre a epidemiologia espacial do cancro tem sido progressivamente reconhecida e o número de estudos nesse campo tem aumentado constantemente, tendo registado um crescimento significativo na última década. Em geral, a epidemiologia espacial é uma área de pesquisa abrangente que inclui uma variedade de assuntos. Entre esses assuntos, e particularmente no caso da epidemiologia espacial do cancro, um tópico importante é o nível de agregação dos dados espaciais. A análise de dados individuais pode apresentar problemas éticos de proteção de dados, pelo que é frequente utilizarem-se dados agregados geograficamente em pesquisas epidemiológicas. Por outro lado, a análise de dados agregados também levanta certas questões metodológicas, tais como: a) a importância de calcular taxas padronizadas (geralmente por sexo e idade) para permitir a comparação de diferentes unidades geográficas; b) a necessidade de levar em conta o fato de que os resultados obtidos em um dado nível de agregação geográfica não podem ser extrapolados como verdadeiros para outros níveis de agregação; e c) a possível existência do “problema dos pequenos números” e a relevância do uso de taxas suavizadas para tentar resolvê-lo. Esta tese faz uma primeira abordagem ao tema através de uma revisão sistemática da literatura sobre a epidemiologia espacial do cancro. Os resultados mostram que as questões consideradas mais frequentemente na literatura estão relacionadas com: a) a metodologia utilizada; b) a distribuição espacial do cancro e a sua evolução temporal; e c) os fatores de risco. A tese procura então abordar esses três aspetos. Para isso, são avaliadas várias questões metodológicas relacionadas com a investigação em epidemiologia espacial do cancro e é analisada a distribuição da mortalidade por todos os tipos de cancro. Considerando as elevadas taxas de incidência e mortalidade do cancro colo-retal na população portuguesa, este tipo de cancro é utilizado como caso de estudo, e a distribuição da sua incidência e mortalidade é estudada e comparada com a distribuição da prevalência dos principais fatores de risco. Em termos metodológicos, verifica-se que a agregação de dados ao nível do concelho permite obter informação detalhada sobre a distribuição geográfica do cancro em Portugal continental, e simultaneamente abordar o problema dos pequenos números. A utilização de métodos estatísticos para calcular taxas suavizadas com base na vizinhança espacial das unidades geográficas analisadas também contribui para a resolução deste último problema. No que diz respeito aos padrões de distribuição espacial do cancro, verifica-se uma heterogeneidade significativa entre os concelhos de Portugal continental, tanto na análise da mortalidade por todos os tipos de cancro como quando se analisa especificamente a incidência e mortalidade do cancro colo-retal. No que diz respeito à distribuição da mortalidade de todos os tipos de cancro, verifica-se que as taxas de mortalidade mais elevadas tendem a agrupar-se em torno do Porto (na costa norte), Lisboa (na costa oeste) e nos concelhos do sudeste do continente. Em relação ao cancro colo-retal, são detetados diferentes padrões de incidência e mortalidade. A distribuição da incidência de cancro colo-retal é mais heterogênea que a mortalidade por este tipo de cancro. Além disso, tanto a incidência como a mortalidade por cancro colo-rectal registam valores particularmente elevados para os homens em dois concelhos do centro de Portugal continental, o que parece exigir uma análise mais detalhada dessa área. Em termos de fatores de risco, foram considerados os seguintes fatores, que foram identificados como tendo possível associação com o cancro colo-retal: tabagismo; ingestão de álcool; e comportamento alimentar. O rastreio, como medida secundária de prevenção que visa a deteção precoce do cancro e a redução da mortalidade, também foi considerado na análise. No entanto, os dados relativos a estes fatores de risco são representativos apenas em unidades geográficas muito agregadas, como as NUTS II. Assim, não foi possível realizar uma análise detalhada desta associação. Para além disto, analisou-se a radiação natural em Portugal Continental, calculando uma média por concelho, e concluiu-se que a sua associação com o cancro colo-retal é geralmente fraca. Este trabalho aponta para uma variedade de tópicos interessantes para estudar em pesquisas futuras, tais como: a) aplicar as mesmas metodologias a outros tipos de cancro; b) estudar a associação geográfica de fatores de risco, tais como fatores sócio demográficos e ambientais, com a incidência e a mortalidade por cancro; c) testar outros métodos espaciais na análise da epidemiologia espacial do cancro em Portugal, como, por exemplo, modelos de krigagem ou multiníveis; e d) estabelecer metodologias adequadas para o estudo da epidemiologia espacial do cancro nas ilhas portuguesas.N/