Caracterización epidemiológica, clínica, microbiológica y genómica de Mycobacterium tuberculosis en el Departamento de Salud La Fe de Valencia

Tesis doctoral, 152 págsANTECEDENTES: La tuberculosis (TB) es una enfermedad asociada a importante morbi-mortalidad en todo el mundo. En la Comunidad Valenciana (CV), al igual que en el resto de España, la tasa de TB según datos oficiales ha disminuido entre el año 2011 y 2015, así como el porcentaje de enfermos inmigrantes y coinfectados con el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), descenso que no se ha visto reflejado, sin embargo, en los datos oficiales del Departamento de Salud (DS) La Fe. La inmigración desde países de alta endemia de TB hace necesario revisar la epidemiología de los pacientes atendidos en el Hospital Universitario y Politécnico (HUP) La Fe y el patrón de resistencias de las cepas aisladas, para comprobar la utilidad de las nuevas técnicas moleculares incorporadas, así como la de la secuenciación completa del genoma (SCG) de Mycobacterium tuberculosis, método que está siendo evaluado como herramienta para el diagnóstico precoz de la enfermedad y de predicción de resistencias. OBJETIVO: Conocer las características epidemiológicas y clínicas de los enfermos con TB confirmada por microbiología en el HUP La Fe de Valencia entre enero de 2011 y diciembre de 2015, así como la repercusión de la SCG de los aislados de MTBC en la gestión de los pacientes. METODOLOGÍA: Estudio descriptivo retrospectivo de las características de los pacientes con TB confirmada por microbiología en el HUP La Fe entre 2011 y 2015 y análisis comparativo con los resultados de linaje y resistencias obtenidos tras SCG de las cepas aisladas en 2014 y 2015. RESULTADOS PRINCIPALES: De los 194 casos confirmados en el HUP La Fe, sólo el 39,8% pertenecían al DS La Fe, por lo que las tasas calculadas no se corresponden con los datos oficiales. La tasa media fue de 9,7 casos/100.000 hab, con mortalidad asociada del 5%. La edad media de los enfermos fue 39,6 años, con un 5,7% de casos en edad infantil, un 10% de coinfectados con el VIH y un 51,3% de inmigrantes, no presentando este grupo diferencias importantes respecto al resto. La mayoría de los casos se concentraron en Torrefiel-Rascaña, en Secciones Censales de alta vulnerabilidad. La presentación clínica predominante fue la pulmonar (62,9%), y la existencia de coinfección con VIH se asoció a forma extrapulmonar. El tiempo de crecimiento medio en medio líquido fue 14,87 días frente a 21,4 en medio sólido. Hubo un 16% de resistencia fenotípica a los fármacos de primera línea, con resistencia a isoniacida (INH) del 9,2% y a rifampicina (RIF) del 3,6%. El linaje predominante fue el L4, con linajes distintos al L4 en pacientes extranjeros. La concordancia kappa de la resistencia detectada por SCG con la fenotípica fue para INH 0,95 (IC: 0,83-0,999) y para RIF 0,999, siendo las mutaciones más frecuentes las localizadas en -15 fabG1-inhA y codón 315 del gen katG para el primer fármaco y codón 450 del gen rpoB para el segundo. CONCLUSIONES: A pesar de que la tasa de TB es menor, el número de inmigrantes afectados es mayor al estimado en el resto de la CV y de España. La presencia de enfermedades de base no es determinante para el desarrollo de enfermedad tuberculosa, pero sí para el desarrollo de formas extrapulmonares, en concreto en el caso de coinfección con VIH. Las técnicas de biología molecular ayudan al diagnóstico, siendo más útiles en las formas pulmonares y en la detección precoz de resistencia a RIF. La SCG es una herramienta más precisa que las moleculares, en concreto para la detección precoz de resistencia a INH en nuestra área, y para el estudio epidemiológico de contactos.Peer reviewe